Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NGFRP08138 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NGFRP08138 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NGFRP08138 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NGFRP08138 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFRP08138 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFRP08138 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFRP08138 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFRP08138 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFRP08138 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFRP08138 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFRP08138 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFRP08138 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NGFRP08138 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NGFRP08138 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NGFRP08138 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NGFRP08138 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFRP08138 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFRP08138 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFRP08138 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFRP08138 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFRP08138 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFRP08138 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFRP08138 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFRP08138 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFRP08138 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NGFRP08138 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NGFRP08138 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFRP08138 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFRP08138 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFRP08138 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFRP08138 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFRP08138 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFRP08138 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFRP08138 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFRP08138 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFRP08138 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFRP08138 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFRP08138 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NGFRP08138 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NGFRP08138 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NGFRP08138 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NGFRP08138 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NGFRP08138 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NGFRP08138 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NGFRP08138 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NGFRP08138 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NGFRP08138 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NGFRP08138 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NGFRP08138 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NGFRP08138 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NGFRP08138 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NGFRP08138 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NGFRP08138 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NGFRP08138 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NGFRP08138 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NGFRP08138 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NGFRP08138 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NGFRP08138 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NGFRP08138 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NGFRP08138 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NGFRP08138 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NGFRP08138 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NGFRP08138 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NGFRP08138 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NGFRP08138 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NGFRP08138 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NGFRP08138 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGFRP08138 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NGFRP08138 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NGFRP08138 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGFRP08138 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms