Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DPB1P04440 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DPB1P04440 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DPB1P04440 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1640.3 ms