Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB4AP04350 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4AP04350 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TUBB4AP04350 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms