Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF1O95521 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF1O95521 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF1O95521 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF1O95521 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF1O95521 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF1O95521 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF1O95521 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF1O95521 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms