Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED4O75132 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED4O75132 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED4O75132 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED4O75132 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED4O75132 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms