Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2AO43736 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2AO43736 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2AO43736 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2AO43736 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms