Protein–RNA interactions for Protein: O14925

TIMM23, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23O14925 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23O14925 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM23O14925 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23O14925 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23O14925 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2317.6 ms