Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASGRF2O14827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGRF2O14827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRF2O14827 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRF2O14827 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms