Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOBPA7XYQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOBPA7XYQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOBPA7XYQ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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