Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE4A6NLX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPDYE4A6NLX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPDYE4A6NLX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPDYE4A6NLX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms