Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1LA6NDD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNDIG1LA6NDD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms