Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX2A2RU54 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX2A2RU54 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMX2A2RU54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX2A2RU54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms