RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YKL050CYKL050C MTC1P47018 478 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YKL050CYKL050C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YKL050CYKL050C TFA1P36100 482 aa6.98□□□□□ -1.29
YKL050CYKL050C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
YKL050CYKL050C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YKL050CYKL050C INO80P53115 1489 aa6.89□□□□□ -1.31
YKL050CYKL050C TAF7Q05021 590 aa6.66□□□□□ -1.34
YKL050CYKL050C DNA2P38859 1522 aa6.57□□□□□ -1.36
YKL050CYKL050C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
YKL050CYKL050C KOG1P38873 1557 aa6.44□□□□□ -1.38
YKL050CYKL050C SWR1Q05471 1514 aa6.4□□□□□ -1.38
YKL050CYKL050C AVT3P36062 692 aa6.34□□□□□ -1.39
YKL050CYKL050C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
YKL050CYKL050C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YKL050CYKL050C TY1B-DR4Q07793 1604 aa6.16□□□□□ -1.42
YKL050CYKL050C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
YKL050CYKL050C DMA1P38823 416 aa6.07□□□□□ -1.44
YKL050CYKL050C LEO1P38439 464 aa6.05□□□□□ -1.44
YKL050CYKL050C MIF2P35201 549 aa5.9□□□□□ -1.46
YKL050CYKL050C ECM5Q03214 1411 aa5.87□□□□□ -1.47
YKL050CYKL050C HSL1P34244 1518 aa5.82□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C THO2P53552 1597 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C REV3P14284 1504 aa5.81□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C MDS3P53094 1487 aa5.79□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C BUD4P47136 1447 aa5.79□□□□□ -1.48
YKL050CYKL050C PTP3P40048 928 aa5.74□□□□□ -1.49
YKL050CYKL050C BPT1P14772 1559 aa5.68□□□□□ -1.5
YKL050CYKL050C HIR3P47171 1648 aa5.67□□□□□ -1.5
YKL050CYKL050C PEP1P32319 1579 aa5.66□□□□□ -1.5
YKL050CYKL050C LEU3P08638 886 aa5.66□□□□□ -1.5
YKL050CYKL050C YFR006WP43590 535 aa5.66□□□□□ -1.5
YKL050CYKL050C SGS1P35187 1447 aa5.63□□□□□ -1.51
YKL050CYKL050C ISW2Q08773 1120 aa5.62□□□□□ -1.51
YKL050CYKL050C AIM44Q99299 758 aa5.6□□□□□ -1.51
YKL050CYKL050C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKL050CYKL050C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKL050CYKL050C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YKL050CYKL050C ATG2P53855 1592 aa5.55□□□□□ -1.52
YKL050CYKL050C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C NAP1P25293 417 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C REB1P21538 810 aa5.51□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C DMA2P53924 522 aa5.51□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C SSP1P38871 571 aa5.5□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C RPG1P38249 964 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C BNI1P41832 1953 aa5.48□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C LTE1P07866 1435 aa5.48□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C TAF2P23255 1407 aa5.48□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C IFH1P39520 1085 aa5.47□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C RLF2Q12495 606 aa5.47□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C SSK2P53599 1579 aa5.46□□□□□ -1.53
YKL050CYKL050C MET5P47169 1442 aa5.45□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C CDC25P04821 1589 aa5.45□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.42□□□□□ -1.54not detected
YKL050CYKL050C IOC4Q04213 475 aa5.41□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C DNF1P32660 1571 aa5.41□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C IRC20Q06554 1556 aa5.41□□□□□ -1.54
YKL050CYKL050C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C RIM101P33400 625 aa5.38□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C URN1Q06525 465 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C ITT1Q04638 464 aa5.36□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C MMS1Q06211 1407 aa5.35□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C RPO31P04051 1460 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C RKR1Q04781 1562 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL050CYKL050C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C FAP1P53971 965 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C SPT21P35209 758 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C UFD4P33202 1483 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C CKB1P43639 278 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C CHD1P32657 1468 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C SIN3P22579 1536 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL050CYKL050C DNF2Q12675 1612 aa5.25□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C OXP1P28273 1286 aa5.24□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C ESP1Q03018 1630 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C PRI1P10363 409 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C DRS2P39524 1355 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C MGA2P40578 1113 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C TY1B-BRQ12193 1756 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C TY1B-GR3Q12316 1755 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C TY1B-ORQ92393 1755 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C YLR271WQ06152 274 aa5.22□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C YOR093CQ12275 1648 aa5.22□□□□□ -1.57
YKL050CYKL050C PAN1P32521 1480 aa5.21□□□□□ -1.58
YKL050CYKL050C YML020WQ03722 664 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL050CYKL050C SCC2Q04002 1493 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL050CYKL050C TOP1P04786 769 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL050CYKL050C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL050CYKL050C TY2B-FP0CX63 1770 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms