Protein–RNA interactions for Protein: P21538

REB1, DNA-binding protein REB1, yeastyeast

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REB1P21538 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.48■■□□□ 1.99
REB1P21538 NOP1YDL014W 984 nt26.94■■□□□ 1.9
REB1P21538 NSR1YGR159C 1245 nt26.48■■□□□ 1.83
REB1P21538 YKL036CYKL036C 393 nt25.72■■□□□ 1.71
REB1P21538 YJL027CYJL027C 417 nt24.17■■□□□ 1.46
REB1P21538 Q0297Q0297 156 nt23.91■■□□□ 1.42
REB1P21538 SCS3YGL126W 1143 nt23.89■■□□□ 1.41
REB1P21538 SRX1YKL086W 384 nt23.6■■□□□ 1.37
REB1P21538 MDJ1YFL016C 1536 nt22.84■■□□□ 1.25
REB1P21538 YCR051WYCR051W 669 nt22.49■■□□□ 1.19
REB1P21538 YOL085CYOL085C 342 nt22.27■■□□□ 1.16
REB1P21538 SCJ1YMR214W 1134 nt22.12■■□□□ 1.13
REB1P21538 PKP1YIL042C 1185 nt21.89■■□□□ 1.09
REB1P21538 ATS1YAL020C 1002 nt21.58■■□□□ 1.05
REB1P21538 RPP1BYDL130W 321 nt21.47■■□□□ 1.03
REB1P21538 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.87■□□□□ 0.93
REB1P21538 YGR139WYGR139W 339 nt20.79■□□□□ 0.92
REB1P21538 CCC1YLR220W 969 nt20.69■□□□□ 0.9
REB1P21538 DBP2YNL112W 1641 nt20.54■□□□□ 0.88
REB1P21538 PET122YER153C 765 nt20.47■□□□□ 0.87
REB1P21538 SCR1SCR1 522 nt20.38■□□□□ 0.85
REB1P21538 RTC3YHR087W 336 nt20.18■□□□□ 0.82
REB1P21538 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.02■□□□□ 0.8
REB1P21538 RRN5YLR141W 1092 nt19.94■□□□□ 0.78
REB1P21538 PST2YDR032C 597 nt19.84■□□□□ 0.77
REB1P21538 RSB1YOR049C 1065 nt19.78■□□□□ 0.76
REB1P21538 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.56■□□□□ 0.72
REB1P21538 YKL097CYKL097C 411 nt19.5■□□□□ 0.71
REB1P21538 RVS167YDR388W 1449 nt19.4■□□□□ 0.7
REB1P21538 YDJ1YNL064C 1230 nt19.31■□□□□ 0.68
REB1P21538 VAR1Q0140 1197 nt19.16■□□□□ 0.66
REB1P21538 YBR190WYBR190W 312 nt19.15■□□□□ 0.66
REB1P21538 SHR5YOL110W 714 nt18.96■□□□□ 0.63
REB1P21538 MOT3YMR070W 1473 nt18.92■□□□□ 0.62
REB1P21538 NME1NME1 340 nt18.88■□□□□ 0.61
REB1P21538 SHU1YHL006C 453 nt18.87■□□□□ 0.61
REB1P21538 GAR1YHR089C 618 nt18.81■□□□□ 0.6
REB1P21538 Q0182Q0182 405 nt18.78■□□□□ 0.6
REB1P21538 YOR139CYOR139C 393 nt18.62■□□□□ 0.57
REB1P21538 CSM2YIL132C 642 nt18.53■□□□□ 0.56
REB1P21538 YDR509WYDR509W 348 nt18.4■□□□□ 0.54
REB1P21538 PAU21YOR394W 495 nt18.37■□□□□ 0.53
REB1P21538 PAU22YPL282C 495 nt18.37■□□□□ 0.53
REB1P21538 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.35■□□□□ 0.53
REB1P21538 DEP1YAL013W 1218 nt18.22■□□□□ 0.51
REB1P21538 NPL3YDR432W 1245 nt18.21■□□□□ 0.51
REB1P21538 ARO7YPR060C 771 nt18.17■□□□□ 0.5
REB1P21538 PAM17YKR065C 594 nt18.16■□□□□ 0.5
REB1P21538 TIR1YER011W 765 nt18.13■□□□□ 0.49
REB1P21538 URN1YPR152C 1398 nt17.94■□□□□ 0.46
REB1P21538 YNL208WYNL208W 600 nt17.94■□□□□ 0.46
REB1P21538 REG2YBR050C 1017 nt17.87■□□□□ 0.45
REB1P21538 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 RPN10YHR200W 807 nt17.79■□□□□ 0.44
REB1P21538 SSA1YAL005C 1929 nt17.76■□□□□ 0.43
REB1P21538 Q0144Q0144 330 nt17.75■□□□□ 0.43
REB1P21538 MNP1YGL068W 585 nt17.74■□□□□ 0.43
REB1P21538 SRB2YHR041C 633 nt17.73■□□□□ 0.43
REB1P21538 BMT5YIL096C 1011 nt17.73■□□□□ 0.43
REB1P21538 BUR6YER159C 429 nt17.67■□□□□ 0.42
REB1P21538 YOL037CYOL037C 354 nt17.67■□□□□ 0.42
REB1P21538 HOM6YJR139C 1080 nt17.63■□□□□ 0.41
REB1P21538 YGR021WYGR021W 873 nt17.58■□□□□ 0.4
REB1P21538 WWM1YFL010C 636 nt17.51■□□□□ 0.39
REB1P21538 Q0142Q0142 177 nt17.48■□□□□ 0.39
REB1P21538 SEM1YDR363W-A 270 nt17.47■□□□□ 0.39
REB1P21538 OPI9YLR338W 858 nt17.47■□□□□ 0.39
REB1P21538 Q0017Q0017 162 nt17.42■□□□□ 0.38
REB1P21538 BSC6YOL137W 1494 nt17.4■□□□□ 0.38
REB1P21538 RKM5YLR137W 1104 nt17.37■□□□□ 0.37
REB1P21538 PUS2YGL063W 1113 nt17.35■□□□□ 0.37
REB1P21538 Q0010Q0010 387 nt17.34■□□□□ 0.37
REB1P21538 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt17.23■□□□□ 0.35
REB1P21538 YLR281CYLR281C 468 nt17.21■□□□□ 0.35
REB1P21538 SAH1YER043C 1350 nt17.19■□□□□ 0.34
REB1P21538 SRN2YLR119W 642 nt17.16■□□□□ 0.34
REB1P21538 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.15■□□□□ 0.34
REB1P21538 YJR120WYJR120W 351 nt17.15■□□□□ 0.34
REB1P21538 YJR018WYJR018W 363 nt17.14■□□□□ 0.33
REB1P21538 WHI5YOR083W 888 nt17.05■□□□□ 0.32
REB1P21538 SSA3YBL075C 1950 nt17.02■□□□□ 0.32
REB1P21538 MRPL8YJL063C 717 nt17.01■□□□□ 0.31
REB1P21538 RPP2BYDR382W 333 nt16.98■□□□□ 0.31
REB1P21538 PUN1YLR414C 792 nt16.95■□□□□ 0.3
REB1P21538 FMP45YDL222C 930 nt16.94■□□□□ 0.3
REB1P21538 YPR011CYPR011C 981 nt16.9■□□□□ 0.3
REB1P21538 AI3Q0060 1248 nt16.88■□□□□ 0.29
REB1P21538 UBX6YJL048C 1191 nt16.87■□□□□ 0.29
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