Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.74■■□□□ 1.55
DIP2Q12220 NOP1YDL014W 984 nt24.24■■□□□ 1.47
DIP2Q12220 NSR1YGR159C 1245 nt23.97■■□□□ 1.43
DIP2Q12220 YKL036CYKL036C 393 nt22.98■■□□□ 1.27
DIP2Q12220 YGR139WYGR139W 339 nt22.8■■□□□ 1.24
DIP2Q12220 MOT3YMR070W 1473 nt22.11■■□□□ 1.13
DIP2Q12220 Q0182Q0182 405 nt22.01■■□□□ 1.11
DIP2Q12220 YJL027CYJL027C 417 nt21.59■■□□□ 1.05
DIP2Q12220 Q0297Q0297 156 nt21.43■■□□□ 1.02
DIP2Q12220 SCS3YGL126W 1143 nt21.26■□□□□ 0.99
DIP2Q12220 NME1NME1 340 nt21.24■□□□□ 0.99
DIP2Q12220 SRX1YKL086W 384 nt21.19■□□□□ 0.98
DIP2Q12220 MDJ1YFL016C 1536 nt20.78■□□□□ 0.92
DIP2Q12220 CSM2YIL132C 642 nt20.56■□□□□ 0.88
DIP2Q12220 PAU21YOR394W 495 nt20.29■□□□□ 0.84
DIP2Q12220 PAU22YPL282C 495 nt20.29■□□□□ 0.84
DIP2Q12220 YCR051WYCR051W 669 nt20.21■□□□□ 0.83
DIP2Q12220 ARO7YPR060C 771 nt20.04■□□□□ 0.8
DIP2Q12220 YOL085CYOL085C 342 nt19.91■□□□□ 0.78
DIP2Q12220 PAM17YKR065C 594 nt19.75■□□□□ 0.75
DIP2Q12220 REG2YBR050C 1017 nt19.6■□□□□ 0.73
DIP2Q12220 PKP1YIL042C 1185 nt19.59■□□□□ 0.73
DIP2Q12220 VAR1Q0140 1197 nt19.57■□□□□ 0.72
DIP2Q12220 SCJ1YMR214W 1134 nt19.52■□□□□ 0.72
DIP2Q12220 YDR509WYDR509W 348 nt19.48■□□□□ 0.71
DIP2Q12220 RPP1BYDL130W 321 nt19.25■□□□□ 0.67
DIP2Q12220 BUR6YER159C 429 nt19.2■□□□□ 0.66
DIP2Q12220 ATS1YAL020C 1002 nt19.18■□□□□ 0.66
DIP2Q12220 BMT5YIL096C 1011 nt19.16■□□□□ 0.66
DIP2Q12220 Q0010Q0010 387 nt19■□□□□ 0.63
DIP2Q12220 Q0144Q0144 330 nt18.85■□□□□ 0.61
DIP2Q12220 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.79■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt18.78■□□□□ 0.6
DIP2Q12220 SEM1YDR363W-A 270 nt18.73■□□□□ 0.59
DIP2Q12220 SRN2YLR119W 642 nt18.71■□□□□ 0.59
DIP2Q12220 CCC1YLR220W 969 nt18.7■□□□□ 0.58
DIP2Q12220 DBP2YNL112W 1641 nt18.61■□□□□ 0.57
DIP2Q12220 ARA2YMR041C 1008 nt18.59■□□□□ 0.57
DIP2Q12220 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt18.41■□□□□ 0.54
DIP2Q12220 PET122YER153C 765 nt18.36■□□□□ 0.53
DIP2Q12220 YLR122CYLR122C 378 nt18.34■□□□□ 0.53
DIP2Q12220 SCR1SCR1 522 nt18.27■□□□□ 0.52
DIP2Q12220 ARP10YDR106W 855 nt18.22■□□□□ 0.51
DIP2Q12220 ABZ2YMR289W 1125 nt18.15■□□□□ 0.5
DIP2Q12220 MET8YBR213W 825 nt18.13■□□□□ 0.49
DIP2Q12220 YCR099CYCR099C 468 nt18.06■□□□□ 0.48
DIP2Q12220 AI3Q0060 1248 nt18.02■□□□□ 0.48
DIP2Q12220 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.01■□□□□ 0.47
DIP2Q12220 Q0142Q0142 177 nt17.98■□□□□ 0.47
DIP2Q12220 CLB6YGR109C 1143 nt17.95■□□□□ 0.46
DIP2Q12220 RRN5YLR141W 1092 nt17.89■□□□□ 0.45
DIP2Q12220 TOM20YGR082W 552 nt17.88■□□□□ 0.45
DIP2Q12220 UTP6YDR449C 1323 nt17.85■□□□□ 0.45
DIP2Q12220 RTC3YHR087W 336 nt17.85■□□□□ 0.45
DIP2Q12220 PET20YPL159C 762 nt17.84■□□□□ 0.45
DIP2Q12220 LCP5YER127W 1074 nt17.73■□□□□ 0.43
DIP2Q12220 RSB1YOR049C 1065 nt17.71■□□□□ 0.43
DIP2Q12220 snR78snR78 87 nt17.69■□□□□ 0.42
DIP2Q12220 PST2YDR032C 597 nt17.66■□□□□ 0.42
DIP2Q12220 SKG1YKR100C 1068 nt17.65■□□□□ 0.42
DIP2Q12220 Q0017Q0017 162 nt17.63■□□□□ 0.41
DIP2Q12220 AI5_BETAQ0075 1065 nt17.62■□□□□ 0.41
DIP2Q12220 URH1YDR400W 1023 nt17.61■□□□□ 0.41
DIP2Q12220 RVS167YDR388W 1449 nt17.59■□□□□ 0.41
DIP2Q12220 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.55■□□□□ 0.4
DIP2Q12220 YNR068CYNR068C 819 nt17.54■□□□□ 0.4
DIP2Q12220 HMT1YBR034C 1047 nt17.52■□□□□ 0.4
DIP2Q12220 Q0255Q0255 1419 nt17.51■□□□□ 0.39
DIP2Q12220 YPL071CYPL071C 471 nt17.48■□□□□ 0.39
DIP2Q12220 YBR190WYBR190W 312 nt17.48■□□□□ 0.39
DIP2Q12220 YPL168WYPL168W 1293 nt17.43■□□□□ 0.38
DIP2Q12220 YOR169CYOR169C 465 nt17.41■□□□□ 0.38
DIP2Q12220 YDJ1YNL064C 1230 nt17.38■□□□□ 0.37
DIP2Q12220 YGL188CYGL188C 174 nt17.37■□□□□ 0.37
DIP2Q12220 YKL097CYKL097C 411 nt17.29■□□□□ 0.36
DIP2Q12220 AIR1YIL079C 1083 nt17.19■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 ATP6Q0085 780 nt17.18■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 YJL118WYJL118W 660 nt17.17■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 URE2YNL229C 1065 nt17.17■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 SSA3YBL075C 1950 nt17.17■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt17.15■□□□□ 0.34
DIP2Q12220 SHR5YOL110W 714 nt17.14■□□□□ 0.33
DIP2Q12220 YMR057CYMR057C 372 nt17.13■□□□□ 0.33
DIP2Q12220 YHM2YMR241W 945 nt17.13■□□□□ 0.33
DIP2Q12220 KTR3YBR205W 1215 nt17.01■□□□□ 0.31
DIP2Q12220 GAR1YHR089C 618 nt16.96■□□□□ 0.31
DIP2Q12220 NEM1YHR004C 1341 nt16.93■□□□□ 0.3
DIP2Q12220 YJL107CYJL107C 1164 nt16.89■□□□□ 0.29
DIP2Q12220 FTR1YER145C 1215 nt16.84■□□□□ 0.29
DIP2Q12220 SHU1YHL006C 453 nt16.82■□□□□ 0.28
DIP2Q12220 THP3YPR045C 1413 nt16.81■□□□□ 0.28
DIP2Q12220 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt16.8■□□□□ 0.28
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