Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YML009W-BYML009W-B 477 nt33.25■■■□□ 2.91
TY1B-BRQ12193 NOP1YDL014W 984 nt31.89■■■□□ 2.69
TY1B-BRQ12193 NSR1YGR159C 1245 nt31.56■■■□□ 2.64
TY1B-BRQ12193 YKL036CYKL036C 393 nt30.71■■■□□ 2.51
TY1B-BRQ12193 YJL027CYJL027C 417 nt28.8■■■□□ 2.2
TY1B-BRQ12193 SCS3YGL126W 1143 nt28.69■■■□□ 2.18
TY1B-BRQ12193 Q0297Q0297 156 nt28.52■■■□□ 2.16
TY1B-BRQ12193 SRX1YKL086W 384 nt28.37■■■□□ 2.13
TY1B-BRQ12193 MDJ1YFL016C 1536 nt27.93■■■□□ 2.06
TY1B-BRQ12193 YCR051WYCR051W 669 nt27.05■■□□□ 1.92
TY1B-BRQ12193 YOL085CYOL085C 342 nt26.42■■□□□ 1.82
TY1B-BRQ12193 PKP1YIL042C 1185 nt26.37■■□□□ 1.81
TY1B-BRQ12193 SCJ1YMR214W 1134 nt25.95■■□□□ 1.74
TY1B-BRQ12193 ATS1YAL020C 1002 nt25.56■■□□□ 1.68
TY1B-BRQ12193 RPP1BYDL130W 321 nt25.55■■□□□ 1.68
TY1B-BRQ12193 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY1B-BRQ12193 DBP2YNL112W 1641 nt24.94■■□□□ 1.58
TY1B-BRQ12193 CCC1YLR220W 969 nt24.93■■□□□ 1.58
TY1B-BRQ12193 PET122YER153C 765 nt24.67■■□□□ 1.54
TY1B-BRQ12193 SCR1SCR1 522 nt24.29■■□□□ 1.48
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt24.03■■□□□ 1.44
TY1B-BRQ12193 RTC3YHR087W 336 nt24.02■■□□□ 1.44
TY1B-BRQ12193 RRN5YLR141W 1092 nt23.8■■□□□ 1.4
TY1B-BRQ12193 RSB1YOR049C 1065 nt23.78■■□□□ 1.4
TY1B-BRQ12193 PST2YDR032C 597 nt23.49■■□□□ 1.35
TY1B-BRQ12193 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.37■■□□□ 1.33
TY1B-BRQ12193 RVS167YDR388W 1449 nt23.3■■□□□ 1.32
TY1B-BRQ12193 YKL097CYKL097C 411 nt23.22■■□□□ 1.31
TY1B-BRQ12193 YBR190WYBR190W 312 nt23.02■■□□□ 1.28
TY1B-BRQ12193 YDJ1YNL064C 1230 nt22.99■■□□□ 1.27
TY1B-BRQ12193 SHR5YOL110W 714 nt22.81■■□□□ 1.24
TY1B-BRQ12193 SHU1YHL006C 453 nt22.63■■□□□ 1.21
TY1B-BRQ12193 GAR1YHR089C 618 nt22.62■■□□□ 1.21
TY1B-BRQ12193 YOR139CYOR139C 393 nt22.35■■□□□ 1.17
TY1B-BRQ12193 DEP1YAL013W 1218 nt22.25■■□□□ 1.15
TY1B-BRQ12193 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22.25■■□□□ 1.15
TY1B-BRQ12193 URN1YPR152C 1398 nt21.83■■□□□ 1.08
TY1B-BRQ12193 NPL3YDR432W 1245 nt21.74■■□□□ 1.07
TY1B-BRQ12193 TIR1YER011W 765 nt21.74■■□□□ 1.07
TY1B-BRQ12193 SRB2YHR041C 633 nt21.64■■□□□ 1.06
TY1B-BRQ12193 MNP1YGL068W 585 nt21.62■■□□□ 1.05
TY1B-BRQ12193 YNL208WYNL208W 600 nt21.46■■□□□ 1.03
TY1B-BRQ12193 SSA1YAL005C 1929 nt21.42■■□□□ 1.02
TY1B-BRQ12193 RPN10YHR200W 807 nt21.31■■□□□ 1
TY1B-BRQ12193 WWM1YFL010C 636 nt21.22■□□□□ 0.99
TY1B-BRQ12193 HOM6YJR139C 1080 nt21.17■□□□□ 0.98
TY1B-BRQ12193 YOL037CYOL037C 354 nt21.14■□□□□ 0.97
TY1B-BRQ12193 OPI9YLR338W 858 nt21.08■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt21.03■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 IMT4tM(CAU)E 72 nt21.03■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 IMT3tM(CAU)J3 72 nt21.03■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 IMT1tM(CAU)O1 72 nt21.03■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 IMT2tM(CAU)P 72 nt21.03■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 YJR120WYJR120W 351 nt21.02■□□□□ 0.96
TY1B-BRQ12193 YGR021WYGR021W 873 nt20.99■□□□□ 0.95
TY1B-BRQ12193 SAH1YER043C 1350 nt20.98■□□□□ 0.95
TY1B-BRQ12193 MOT3YMR070W 1473 nt20.78■□□□□ 0.92
TY1B-BRQ12193 RKM5YLR137W 1104 nt20.77■□□□□ 0.92
TY1B-BRQ12193 YJR018WYJR018W 363 nt20.72■□□□□ 0.91
TY1B-BRQ12193 PUS2YGL063W 1113 nt20.72■□□□□ 0.91
TY1B-BRQ12193 SSA3YBL075C 1950 nt20.57■□□□□ 0.88
TY1B-BRQ12193 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20.56■□□□□ 0.88
TY1B-BRQ12193 BSC6YOL137W 1494 nt20.53■□□□□ 0.88
TY1B-BRQ12193 YLR281CYLR281C 468 nt20.51■□□□□ 0.87
TY1B-BRQ12193 ARE1YCR048W 1833 nt20.46■□□□□ 0.87
TY1B-BRQ12193 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20.43■□□□□ 0.86
TY1B-BRQ12193 WHI5YOR083W 888 nt20.41■□□□□ 0.86
TY1B-BRQ12193 PUT4YOR348C 1884 nt20.39■□□□□ 0.86
TY1B-BRQ12193 PUN1YLR414C 792 nt20.39■□□□□ 0.85
TY1B-BRQ12193 YLR236CYLR236C 324 nt20.38■□□□□ 0.85
TY1B-BRQ12193 RPP2BYDR382W 333 nt20.35■□□□□ 0.85
TY1B-BRQ12193 FMP45YDL222C 930 nt20.34■□□□□ 0.85
TY1B-BRQ12193 YPR011CYPR011C 981 nt20.31■□□□□ 0.84
TY1B-BRQ12193 BDH2YAL061W 1254 nt20.29■□□□□ 0.84
TY1B-BRQ12193 PTC2YER089C 1395 nt20.07■□□□□ 0.8
TY1B-BRQ12193 DSK2YMR276W 1122 nt20.06■□□□□ 0.8
TY1B-BRQ12193 UBX6YJL048C 1191 nt20■□□□□ 0.79
TY1B-BRQ12193 MRPL8YJL063C 717 nt19.94■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 LPX1YOR084W 1164 nt19.93■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 BUD23YCR047C 828 nt19.92■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 POA1YBR022W 534 nt19.92■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 YBL100CYBL100C 315 nt19.91■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 YCH1YGR203W 447 nt19.9■□□□□ 0.78
TY1B-BRQ12193 RTG1YOL067C 534 nt19.88■□□□□ 0.77
TY1B-BRQ12193 SPP1YPL138C 1062 nt19.88■□□□□ 0.77
TY1B-BRQ12193 FIS1YIL065C 468 nt19.88■□□□□ 0.77
TY1B-BRQ12193 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.84■□□□□ 0.77
TY1B-BRQ12193 LSM3YLR438C-A 270 nt19.8■□□□□ 0.76
TY1B-BRQ12193 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19.77■□□□□ 0.76
TY1B-BRQ12193 YEL076CYEL076C 651 nt19.77■□□□□ 0.76
TY1B-BRQ12193 YLR464WYLR464W 651 nt19.77■□□□□ 0.76
TY1B-BRQ12193 IMP2'YIL154C 1041 nt19.72■□□□□ 0.75
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