Protein–RNA interactions for Protein: P53552

THO2, THO complex subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THO2P53552 YML009W-BYML009W-B 477 nt35.77■■■■□ 3.32
THO2P53552 NOP1YDL014W 984 nt34.64■■■■□ 3.14
THO2P53552 NSR1YGR159C 1245 nt33.97■■■■□ 3.03
THO2P53552 YKL036CYKL036C 393 nt33.26■■■□□ 2.91
THO2P53552 YJL027CYJL027C 417 nt31.27■■■□□ 2.6
THO2P53552 SCS3YGL126W 1143 nt31.03■■■□□ 2.56
THO2P53552 Q0297Q0297 156 nt30.79■■■□□ 2.52
THO2P53552 SRX1YKL086W 384 nt30.51■■■□□ 2.47
THO2P53552 MDJ1YFL016C 1536 nt29.76■■■□□ 2.35
THO2P53552 YCR051WYCR051W 669 nt29.19■■■□□ 2.26
THO2P53552 YOL085CYOL085C 342 nt28.64■■■□□ 2.18
THO2P53552 PKP1YIL042C 1185 nt28.45■■■□□ 2.14
THO2P53552 SCJ1YMR214W 1134 nt28.38■■■□□ 2.13
THO2P53552 ATS1YAL020C 1002 nt27.77■■■□□ 2.04
THO2P53552 RPP1BYDL130W 321 nt27.66■■■□□ 2.02
THO2P53552 TRN1tP(UGG)A 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 SUF9tP(UGG)F 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 SUF8tP(UGG)H 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 SUF7tP(UGG)M 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 SUF11tP(UGG)O2 72 nt27.07■■□□□ 1.92
THO2P53552 CCC1YLR220W 969 nt26.82■■□□□ 1.88
THO2P53552 PET122YER153C 765 nt26.57■■□□□ 1.84
THO2P53552 DBP2YNL112W 1641 nt26.54■■□□□ 1.84
THO2P53552 SCR1SCR1 522 nt26.37■■□□□ 1.81
THO2P53552 RTC3YHR087W 336 nt26.18■■□□□ 1.78
THO2P53552 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt25.86■■□□□ 1.73
THO2P53552 RSB1YOR049C 1065 nt25.72■■□□□ 1.71
THO2P53552 RRN5YLR141W 1092 nt25.69■■□□□ 1.7
THO2P53552 PST2YDR032C 597 nt25.45■■□□□ 1.66
THO2P53552 YKL097CYKL097C 411 nt25.28■■□□□ 1.64
THO2P53552 YER088W-BYER088W-B 147 nt25.22■■□□□ 1.63
THO2P53552 RVS167YDR388W 1449 nt25.12■■□□□ 1.61
THO2P53552 YDJ1YNL064C 1230 nt24.82■■□□□ 1.56
THO2P53552 YBR190WYBR190W 312 nt24.71■■□□□ 1.55
THO2P53552 SHR5YOL110W 714 nt24.54■■□□□ 1.52
THO2P53552 SHU1YHL006C 453 nt24.44■■□□□ 1.5
THO2P53552 GAR1YHR089C 618 nt24.36■■□□□ 1.49
THO2P53552 YOR139CYOR139C 393 nt24.12■■□□□ 1.45
THO2P53552 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt23.86■■□□□ 1.41
THO2P53552 DEP1YAL013W 1218 nt23.76■■□□□ 1.39
THO2P53552 NPL3YDR432W 1245 nt23.65■■□□□ 1.38
THO2P53552 TIR1YER011W 765 nt23.41■■□□□ 1.34
THO2P53552 URN1YPR152C 1398 nt23.31■■□□□ 1.32
THO2P53552 MNP1YGL068W 585 nt23.23■■□□□ 1.31
THO2P53552 YNL208WYNL208W 600 nt23.12■■□□□ 1.29
THO2P53552 SRB2YHR041C 633 nt23.03■■□□□ 1.28
THO2P53552 RPN10YHR200W 807 nt23.02■■□□□ 1.28
THO2P53552 SSA1YAL005C 1929 nt22.94■■□□□ 1.26
THO2P53552 YOL037CYOL037C 354 nt22.94■■□□□ 1.26
THO2P53552 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt22.83■■□□□ 1.25
THO2P53552 IMT4tM(CAU)E 72 nt22.83■■□□□ 1.25
THO2P53552 IMT3tM(CAU)J3 72 nt22.83■■□□□ 1.25
THO2P53552 IMT1tM(CAU)O1 72 nt22.83■■□□□ 1.25
THO2P53552 IMT2tM(CAU)P 72 nt22.83■■□□□ 1.25
THO2P53552 HOM6YJR139C 1080 nt22.8■■□□□ 1.24
THO2P53552 YGR021WYGR021W 873 nt22.75■■□□□ 1.23
THO2P53552 WWM1YFL010C 636 nt22.73■■□□□ 1.23
THO2P53552 MOT3YMR070W 1473 nt22.62■■□□□ 1.21
THO2P53552 BSC6YOL137W 1494 nt22.6■■□□□ 1.21
THO2P53552 OPI9YLR338W 858 nt22.53■■□□□ 1.2
THO2P53552 RKM5YLR137W 1104 nt22.46■■□□□ 1.19
THO2P53552 PUS2YGL063W 1113 nt22.43■■□□□ 1.18
THO2P53552 SAH1YER043C 1350 nt22.39■■□□□ 1.18
THO2P53552 YJR120WYJR120W 351 nt22.3■■□□□ 1.16
THO2P53552 YJR018WYJR018W 363 nt22.17■■□□□ 1.14
THO2P53552 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt22.16■■□□□ 1.14
THO2P53552 YLR281CYLR281C 468 nt22.16■■□□□ 1.14
THO2P53552 FMP45YDL222C 930 nt22.04■■□□□ 1.12
THO2P53552 WHI5YOR083W 888 nt22.02■■□□□ 1.12
THO2P53552 PUT4YOR348C 1884 nt22■■□□□ 1.11
THO2P53552 RPP2BYDR382W 333 nt21.98■■□□□ 1.11
THO2P53552 ARE1YCR048W 1833 nt21.94■■□□□ 1.1
THO2P53552 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.93■■□□□ 1.1
THO2P53552 YLR236CYLR236C 324 nt21.91■■□□□ 1.1
THO2P53552 PUN1YLR414C 792 nt21.88■■□□□ 1.09
THO2P53552 SSA3YBL075C 1950 nt21.88■■□□□ 1.09
THO2P53552 MRPL8YJL063C 717 nt21.82■■□□□ 1.08
THO2P53552 UBX6YJL048C 1191 nt21.79■■□□□ 1.08
THO2P53552 BDH2YAL061W 1254 nt21.77■■□□□ 1.08
THO2P53552 YPR011CYPR011C 981 nt21.76■■□□□ 1.07
THO2P53552 DSK2YMR276W 1122 nt21.73■■□□□ 1.07
THO2P53552 YCH1YGR203W 447 nt21.65■■□□□ 1.06
THO2P53552 ADO1YJR105W 1023 nt21.52■■□□□ 1.04
THO2P53552 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt21.49■■□□□ 1.03
THO2P53552 YEL076CYEL076C 651 nt21.49■■□□□ 1.03
THO2P53552 YLR464WYLR464W 651 nt21.49■■□□□ 1.03
THO2P53552 PTC2YER089C 1395 nt21.48■■□□□ 1.03
THO2P53552 POA1YBR022W 534 nt21.43■■□□□ 1.02
THO2P53552 LPX1YOR084W 1164 nt21.42■■□□□ 1.02
THO2P53552 SPP1YPL138C 1062 nt21.41■■□□□ 1.02
THO2P53552 LSM3YLR438C-A 270 nt21.38■■□□□ 1.01
THO2P53552 BUD23YCR047C 828 nt21.37■■□□□ 1.01
THO2P53552 IMP2'YIL154C 1041 nt21.37■■□□□ 1.01
THO2P53552 RTG1YOL067C 534 nt21.37■■□□□ 1.01
THO2P53552 YBL100CYBL100C 315 nt21.34■■□□□ 1.01
THO2P53552 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms