Protein–RNA interactions for Protein: Q08773

ISW2, ISWI chromatin-remodeling complex ATPase ISW2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ISW2Q08773 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.48■■□□□ 1.35
ISW2Q08773 NSR1YGR159C 1245 nt23.26■■□□□ 1.31
ISW2Q08773 NOP1YDL014W 984 nt22.74■■□□□ 1.23
ISW2Q08773 YGR139WYGR139W 339 nt22.29■■□□□ 1.16
ISW2Q08773 VAR1Q0140 1197 nt21.39■■□□□ 1.01
ISW2Q08773 YKL036CYKL036C 393 nt21.25■□□□□ 0.99
ISW2Q08773 MDJ1YFL016C 1536 nt20.8■□□□□ 0.92
ISW2Q08773 YDR509WYDR509W 348 nt20.13■□□□□ 0.81
ISW2Q08773 Q0297Q0297 156 nt20.04■□□□□ 0.8
ISW2Q08773 SRX1YKL086W 384 nt19.89■□□□□ 0.77
ISW2Q08773 YJL027CYJL027C 417 nt19.86■□□□□ 0.77
ISW2Q08773 NME1NME1 340 nt19.84■□□□□ 0.77
ISW2Q08773 CSM2YIL132C 642 nt19.73■□□□□ 0.75
ISW2Q08773 PAM17YKR065C 594 nt19.59■□□□□ 0.73
ISW2Q08773 PAU21YOR394W 495 nt19.58■□□□□ 0.72
ISW2Q08773 PAU22YPL282C 495 nt19.58■□□□□ 0.72
ISW2Q08773 Q0017Q0017 162 nt19.57■□□□□ 0.72
ISW2Q08773 SCS3YGL126W 1143 nt19.48■□□□□ 0.71
ISW2Q08773 Q0142Q0142 177 nt19.45■□□□□ 0.7
ISW2Q08773 MOT3YMR070W 1473 nt19.45■□□□□ 0.7
ISW2Q08773 ARO7YPR060C 771 nt19.39■□□□□ 0.69
ISW2Q08773 Q0144Q0144 330 nt19.37■□□□□ 0.69
ISW2Q08773 Q0182Q0182 405 nt19.24■□□□□ 0.67
ISW2Q08773 BMT5YIL096C 1011 nt19.12■□□□□ 0.65
ISW2Q08773 REG2YBR050C 1017 nt19.09■□□□□ 0.65
ISW2Q08773 BUR6YER159C 429 nt19.03■□□□□ 0.64
ISW2Q08773 SEM1YDR363W-A 270 nt18.98■□□□□ 0.63
ISW2Q08773 YCR051WYCR051W 669 nt18.92■□□□□ 0.62
ISW2Q08773 Q0010Q0010 387 nt18.6■□□□□ 0.57
ISW2Q08773 Q0255Q0255 1419 nt18.58■□□□□ 0.57
ISW2Q08773 AI5_BETAQ0075 1065 nt18.55■□□□□ 0.56
ISW2Q08773 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt18.51■□□□□ 0.55
ISW2Q08773 YOR169CYOR169C 465 nt18.47■□□□□ 0.55
ISW2Q08773 YGL188CYGL188C 174 nt18.44■□□□□ 0.54
ISW2Q08773 SRN2YLR119W 642 nt18.44■□□□□ 0.54
ISW2Q08773 YOL085CYOL085C 342 nt18.4■□□□□ 0.54
ISW2Q08773 AI3Q0060 1248 nt18.38■□□□□ 0.53
ISW2Q08773 DBP2YNL112W 1641 nt18.32■□□□□ 0.52
ISW2Q08773 YCR099CYCR099C 468 nt18.21■□□□□ 0.51
ISW2Q08773 ARP10YDR106W 855 nt18.09■□□□□ 0.49
ISW2Q08773 ATP6Q0085 780 nt18.02■□□□□ 0.48
ISW2Q08773 TRN1tP(UGG)A 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 SUF9tP(UGG)F 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 SUF8tP(UGG)H 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 SUF7tP(UGG)M 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 PKP1YIL042C 1185 nt18■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 RPP1BYDL130W 321 nt17.96■□□□□ 0.47
ISW2Q08773 PET20YPL159C 762 nt17.91■□□□□ 0.46
ISW2Q08773 CCC1YLR220W 969 nt17.89■□□□□ 0.45
ISW2Q08773 ARA2YMR041C 1008 nt17.87■□□□□ 0.45
ISW2Q08773 AIR1YIL079C 1083 nt17.86■□□□□ 0.45
ISW2Q08773 SCJ1YMR214W 1134 nt17.73■□□□□ 0.43
ISW2Q08773 YNR068CYNR068C 819 nt17.65■□□□□ 0.42
ISW2Q08773 YBR190WYBR190W 312 nt17.65■□□□□ 0.42
ISW2Q08773 snR78snR78 87 nt17.6■□□□□ 0.41
ISW2Q08773 KTR3YBR205W 1215 nt17.55■□□□□ 0.4
ISW2Q08773 ABZ2YMR289W 1125 nt17.54■□□□□ 0.4
ISW2Q08773 YLR122CYLR122C 378 nt17.53■□□□□ 0.4
ISW2Q08773 ATS1YAL020C 1002 nt17.52■□□□□ 0.4
ISW2Q08773 YPL168WYPL168W 1293 nt17.46■□□□□ 0.39
ISW2Q08773 UTP6YDR449C 1323 nt17.45■□□□□ 0.38
ISW2Q08773 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt17.41■□□□□ 0.38
ISW2Q08773 NEM1YHR004C 1341 nt17.4■□□□□ 0.38
ISW2Q08773 SKG1YKR100C 1068 nt17.39■□□□□ 0.37
ISW2Q08773 PHO92YDR374C 921 nt17.35■□□□□ 0.37
ISW2Q08773 RTC3YHR087W 336 nt17.34■□□□□ 0.37
ISW2Q08773 RVS167YDR388W 1449 nt17.22■□□□□ 0.35
ISW2Q08773 YHL044WYHL044W 708 nt17.13■□□□□ 0.33
ISW2Q08773 PET122YER153C 765 nt17.11■□□□□ 0.33
ISW2Q08773 AST1YBL069W 1290 nt17.09■□□□□ 0.33
ISW2Q08773 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.03■□□□□ 0.32
ISW2Q08773 STD1YOR047C 1335 nt17.02■□□□□ 0.32
ISW2Q08773 URE2YNL229C 1065 nt17.02■□□□□ 0.32
ISW2Q08773 SCR1SCR1 522 nt16.99■□□□□ 0.31
ISW2Q08773 RPM1RPM1 483 nt16.94■□□□□ 0.3
ISW2Q08773 TOM20YGR082W 552 nt16.93■□□□□ 0.3
ISW2Q08773 YPL071CYPL071C 471 nt16.88■□□□□ 0.29
ISW2Q08773 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt16.87■□□□□ 0.29
ISW2Q08773 PEX27YOR193W 1131 nt16.86■□□□□ 0.29
ISW2Q08773 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt16.83■□□□□ 0.28
ISW2Q08773 FAR3YMR052W 615 nt16.81■□□□□ 0.28
ISW2Q08773 HMT1YBR034C 1047 nt16.77■□□□□ 0.28
ISW2Q08773 FTR1YER145C 1215 nt16.76■□□□□ 0.27
ISW2Q08773 GTT3YEL017W 1014 nt16.73■□□□□ 0.27
ISW2Q08773 YDR008CYDR008C 351 nt16.68■□□□□ 0.26
ISW2Q08773 LCP5YER127W 1074 nt16.67■□□□□ 0.26
ISW2Q08773 MET8YBR213W 825 nt16.66■□□□□ 0.26
ISW2Q08773 RRN5YLR141W 1092 nt16.62■□□□□ 0.25
ISW2Q08773 SHR5YOL110W 714 nt16.61■□□□□ 0.25
ISW2Q08773 LSM12YHR121W 564 nt16.57■□□□□ 0.24
ISW2Q08773 PUS9YDL036C 1389 nt16.55■□□□□ 0.24
ISW2Q08773 URH1YDR400W 1023 nt16.48■□□□□ 0.23
ISW2Q08773 YLR036CYLR036C 612 nt16.47■□□□□ 0.23
ISW2Q08773 HAS1YMR290C 1518 nt16.46■□□□□ 0.23
ISW2Q08773 IRC14YOR135C 342 nt16.46■□□□□ 0.23
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