Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

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Length 1,592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 YML009W-BYML009W-B 477 nt35.09■■■■□ 3.21
ATG2P53855 NOP1YDL014W 984 nt33.85■■■■□ 3.01
ATG2P53855 NSR1YGR159C 1245 nt33.38■■■□□ 2.93
ATG2P53855 YKL036CYKL036C 393 nt32.47■■■□□ 2.79
ATG2P53855 YJL027CYJL027C 417 nt30.5■■■□□ 2.47
ATG2P53855 SCS3YGL126W 1143 nt30.31■■■□□ 2.44
ATG2P53855 Q0297Q0297 156 nt30.13■■■□□ 2.41
ATG2P53855 SRX1YKL086W 384 nt29.9■■■□□ 2.38
ATG2P53855 MDJ1YFL016C 1536 nt29.43■■■□□ 2.3
ATG2P53855 YCR051WYCR051W 669 nt28.57■■■□□ 2.16
ATG2P53855 YOL085CYOL085C 342 nt27.99■■■□□ 2.07
ATG2P53855 PKP1YIL042C 1185 nt27.86■■■□□ 2.05
ATG2P53855 SCJ1YMR214W 1134 nt27.52■■■□□ 2
ATG2P53855 ATS1YAL020C 1002 nt27.07■■□□□ 1.92
ATG2P53855 RPP1BYDL130W 321 nt27.05■■□□□ 1.92
ATG2P53855 TRN1tP(UGG)A 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 SUF9tP(UGG)F 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 SUF8tP(UGG)H 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 SUF7tP(UGG)M 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 SUF11tP(UGG)O2 72 nt26.61■■□□□ 1.85
ATG2P53855 CCC1YLR220W 969 nt26.33■■□□□ 1.81
ATG2P53855 DBP2YNL112W 1641 nt26.25■■□□□ 1.79
ATG2P53855 PET122YER153C 765 nt26.06■■□□□ 1.76
ATG2P53855 SCR1SCR1 522 nt25.72■■□□□ 1.71
ATG2P53855 RTC3YHR087W 336 nt25.44■■□□□ 1.66
ATG2P53855 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt25.38■■□□□ 1.65
ATG2P53855 RRN5YLR141W 1092 nt25.14■■□□□ 1.62
ATG2P53855 RSB1YOR049C 1065 nt25.13■■□□□ 1.61
ATG2P53855 PST2YDR032C 597 nt24.84■■□□□ 1.57
ATG2P53855 YER088W-BYER088W-B 147 nt24.7■■□□□ 1.54
ATG2P53855 RVS167YDR388W 1449 nt24.64■■□□□ 1.54
ATG2P53855 YKL097CYKL097C 411 nt24.59■■□□□ 1.53
ATG2P53855 YDJ1YNL064C 1230 nt24.31■■□□□ 1.48
ATG2P53855 YBR190WYBR190W 312 nt24.31■■□□□ 1.48
ATG2P53855 SHR5YOL110W 714 nt24.11■■□□□ 1.45
ATG2P53855 SHU1YHL006C 453 nt23.91■■□□□ 1.42
ATG2P53855 GAR1YHR089C 618 nt23.9■■□□□ 1.42
ATG2P53855 YOR139CYOR139C 393 nt23.56■■□□□ 1.36
ATG2P53855 DEP1YAL013W 1218 nt23.42■■□□□ 1.34
ATG2P53855 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt23.4■■□□□ 1.34
ATG2P53855 NPL3YDR432W 1245 nt23.02■■□□□ 1.28
ATG2P53855 URN1YPR152C 1398 nt22.98■■□□□ 1.27
ATG2P53855 TIR1YER011W 765 nt22.98■■□□□ 1.27
ATG2P53855 MNP1YGL068W 585 nt22.8■■□□□ 1.24
ATG2P53855 SRB2YHR041C 633 nt22.76■■□□□ 1.23
ATG2P53855 YNL208WYNL208W 600 nt22.72■■□□□ 1.23
ATG2P53855 SSA1YAL005C 1929 nt22.6■■□□□ 1.21
ATG2P53855 RPN10YHR200W 807 nt22.58■■□□□ 1.2
ATG2P53855 YOL037CYOL037C 354 nt22.38■■□□□ 1.17
ATG2P53855 HOM6YJR139C 1080 nt22.36■■□□□ 1.17
ATG2P53855 WWM1YFL010C 636 nt22.34■■□□□ 1.17
ATG2P53855 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt22.27■■□□□ 1.16
ATG2P53855 IMT4tM(CAU)E 72 nt22.27■■□□□ 1.16
ATG2P53855 IMT3tM(CAU)J3 72 nt22.27■■□□□ 1.16
ATG2P53855 IMT1tM(CAU)O1 72 nt22.27■■□□□ 1.16
ATG2P53855 IMT2tM(CAU)P 72 nt22.27■■□□□ 1.16
ATG2P53855 OPI9YLR338W 858 nt22.23■■□□□ 1.15
ATG2P53855 YGR021WYGR021W 873 nt22.22■■□□□ 1.15
ATG2P53855 YJR120WYJR120W 351 nt22.08■■□□□ 1.12
ATG2P53855 SAH1YER043C 1350 nt22.07■■□□□ 1.12
ATG2P53855 MOT3YMR070W 1473 nt22.03■■□□□ 1.12
ATG2P53855 RKM5YLR137W 1104 nt22.01■■□□□ 1.11
ATG2P53855 PUS2YGL063W 1113 nt21.89■■□□□ 1.09
ATG2P53855 YJR018WYJR018W 363 nt21.84■■□□□ 1.09
ATG2P53855 BSC6YOL137W 1494 nt21.8■■□□□ 1.08
ATG2P53855 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt21.71■■□□□ 1.07
ATG2P53855 YLR281CYLR281C 468 nt21.67■■□□□ 1.06
ATG2P53855 SSA3YBL075C 1950 nt21.66■■□□□ 1.06
ATG2P53855 RPP2BYDR382W 333 nt21.54■■□□□ 1.04
ATG2P53855 PUN1YLR414C 792 nt21.54■■□□□ 1.04
ATG2P53855 WHI5YOR083W 888 nt21.54■■□□□ 1.04
ATG2P53855 ARE1YCR048W 1833 nt21.53■■□□□ 1.04
ATG2P53855 FMP45YDL222C 930 nt21.52■■□□□ 1.04
ATG2P53855 YLR236CYLR236C 324 nt21.51■■□□□ 1.03
ATG2P53855 PUT4YOR348C 1884 nt21.49■■□□□ 1.03
ATG2P53855 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.48■■□□□ 1.03
ATG2P53855 BDH2YAL061W 1254 nt21.4■■□□□ 1.02
ATG2P53855 YPR011CYPR011C 981 nt21.38■■□□□ 1.01
ATG2P53855 DSK2YMR276W 1122 nt21.23■□□□□ 0.99
ATG2P53855 PTC2YER089C 1395 nt21.2■□□□□ 0.98
ATG2P53855 UBX6YJL048C 1191 nt21.18■□□□□ 0.98
ATG2P53855 MRPL8YJL063C 717 nt21.15■□□□□ 0.98
ATG2P53855 YCH1YGR203W 447 nt21.1■□□□□ 0.97
ATG2P53855 YBL100CYBL100C 315 nt21.02■□□□□ 0.95
ATG2P53855 LPX1YOR084W 1164 nt21.02■□□□□ 0.95
ATG2P53855 SPP1YPL138C 1062 nt21■□□□□ 0.95
ATG2P53855 BUD23YCR047C 828 nt20.96■□□□□ 0.95
ATG2P53855 LSM3YLR438C-A 270 nt20.96■□□□□ 0.95
ATG2P53855 POA1YBR022W 534 nt20.96■□□□□ 0.95
ATG2P53855 FIS1YIL065C 468 nt20.95■□□□□ 0.94
ATG2P53855 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt20.93■□□□□ 0.94
ATG2P53855 YEL076CYEL076C 651 nt20.93■□□□□ 0.94
ATG2P53855 YLR464WYLR464W 651 nt20.93■□□□□ 0.94
ATG2P53855 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20.91■□□□□ 0.94
ATG2P53855 RTG1YOL067C 534 nt20.9■□□□□ 0.94
ATG2P53855 ADO1YJR105W 1023 nt20.85■□□□□ 0.93
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