Protein–RNA interactions for Protein: P28273

OXP1, 5-oxoprolinase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OXP1P28273 NSR1YGR159C 1245 nt19.98■□□□□ 0.79
OXP1P28273 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.66■□□□□ 0.74
OXP1P28273 YGR139WYGR139W 339 nt19.02■□□□□ 0.64
OXP1P28273 NOP1YDL014W 984 nt18.76■□□□□ 0.59
OXP1P28273 MOT3YMR070W 1473 nt18.59■□□□□ 0.57
OXP1P28273 Q0182Q0182 405 nt18.4■□□□□ 0.54
OXP1P28273 MDJ1YFL016C 1536 nt18.39■□□□□ 0.54
OXP1P28273 NME1NME1 340 nt17.73■□□□□ 0.43
OXP1P28273 CSM2YIL132C 642 nt17.2■□□□□ 0.34
OXP1P28273 PAU21YOR394W 495 nt16.96■□□□□ 0.31
OXP1P28273 PAU22YPL282C 495 nt16.96■□□□□ 0.31
OXP1P28273 YKL036CYKL036C 393 nt16.93■□□□□ 0.3
OXP1P28273 ARO7YPR060C 771 nt16.75■□□□□ 0.27
OXP1P28273 YJL027CYJL027C 417 nt16.74■□□□□ 0.27
OXP1P28273 SRX1YKL086W 384 nt16.53■□□□□ 0.24
OXP1P28273 PAM17YKR065C 594 nt16.47■□□□□ 0.23
OXP1P28273 Q0297Q0297 156 nt16.42■□□□□ 0.22
OXP1P28273 VAR1Q0140 1197 nt16.35■□□□□ 0.21
OXP1P28273 REG2YBR050C 1017 nt16.33■□□□□ 0.2
OXP1P28273 YDR509WYDR509W 348 nt16.3■□□□□ 0.2
OXP1P28273 DBP2YNL112W 1641 nt16.17■□□□□ 0.18
OXP1P28273 BUR6YER159C 429 nt16.02■□□□□ 0.16
OXP1P28273 BMT5YIL096C 1011 nt15.99■□□□□ 0.15
OXP1P28273 Q0010Q0010 387 nt15.92■□□□□ 0.14
OXP1P28273 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt15.72■□□□□ 0.11
OXP1P28273 Q0144Q0144 330 nt15.7■□□□□ 0.1
OXP1P28273 YBR190WYBR190W 312 nt15.7■□□□□ 0.1
OXP1P28273 SEM1YDR363W-A 270 nt15.65■□□□□ 0.1
OXP1P28273 SRN2YLR119W 642 nt15.62■□□□□ 0.09
OXP1P28273 YCR051WYCR051W 669 nt15.57■□□□□ 0.08
OXP1P28273 ARA2YMR041C 1008 nt15.56■□□□□ 0.08
OXP1P28273 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt15.37■□□□□ 0.05
OXP1P28273 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.35■□□□□ 0.05
OXP1P28273 YLR122CYLR122C 378 nt15.31■□□□□ 0.04
OXP1P28273 SCS3YGL126W 1143 nt15.26■□□□□ 0.03
OXP1P28273 RTC3YHR087W 336 nt15.22■□□□□ 0.03
OXP1P28273 SSA3YBL075C 1950 nt15.2■□□□□ 0.02
OXP1P28273 ARP10YDR106W 855 nt15.18■□□□□ 0.02
OXP1P28273 YCR099CYCR099C 468 nt15.15■□□□□ 0.02
OXP1P28273 ABZ2YMR289W 1125 nt15.13■□□□□ 0.01
OXP1P28273 MET8YBR213W 825 nt15.1■□□□□ 0.01
OXP1P28273 AI3Q0060 1248 nt15.09■□□□□ 0.01
OXP1P28273 CCC1YLR220W 969 nt15.06■□□□□ 0
OXP1P28273 CLB6YGR109C 1143 nt15.03■□□□□ -0
OXP1P28273 TOM20YGR082W 552 nt15.02■□□□□ -0
OXP1P28273 Q0142Q0142 177 nt15.01□□□□□ -0.01
OXP1P28273 UTP6YDR449C 1323 nt14.92□□□□□ -0.02
OXP1P28273 SCJ1YMR214W 1134 nt14.91□□□□□ -0.02
OXP1P28273 PET20YPL159C 762 nt14.9□□□□□ -0.02
OXP1P28273 PUT4YOR348C 1884 nt14.84□□□□□ -0.03
OXP1P28273 LCP5YER127W 1074 nt14.8□□□□□ -0.04
OXP1P28273 SKG1YKR100C 1068 nt14.77□□□□□ -0.05
OXP1P28273 YOL085CYOL085C 342 nt14.77□□□□□ -0.05
OXP1P28273 URH1YDR400W 1023 nt14.76□□□□□ -0.05
OXP1P28273 HMT1YBR034C 1047 nt14.75□□□□□ -0.05
OXP1P28273 snR78snR78 87 nt14.74□□□□□ -0.05
OXP1P28273 Q0017Q0017 162 nt14.73□□□□□ -0.05
OXP1P28273 RVS167YDR388W 1449 nt14.72□□□□□ -0.05
OXP1P28273 RPP1BYDL130W 321 nt14.7□□□□□ -0.06
OXP1P28273 Q0255Q0255 1419 nt14.69□□□□□ -0.06
OXP1P28273 AI5_BETAQ0075 1065 nt14.66□□□□□ -0.06
OXP1P28273 PKP1YIL042C 1185 nt14.61□□□□□ -0.07
OXP1P28273 YPL071CYPL071C 471 nt14.59□□□□□ -0.07
OXP1P28273 YOR169CYOR169C 465 nt14.58□□□□□ -0.08
OXP1P28273 YNR068CYNR068C 819 nt14.57□□□□□ -0.08
OXP1P28273 YPL168WYPL168W 1293 nt14.57□□□□□ -0.08
OXP1P28273 YGL188CYGL188C 174 nt14.5□□□□□ -0.09
OXP1P28273 ARE1YCR048W 1833 nt14.41□□□□□ -0.1
OXP1P28273 ATP6Q0085 780 nt14.39□□□□□ -0.11
OXP1P28273 AIR1YIL079C 1083 nt14.37□□□□□ -0.11
OXP1P28273 YHM2YMR241W 945 nt14.36□□□□□ -0.11
OXP1P28273 YJL118WYJL118W 660 nt14.33□□□□□ -0.12
OXP1P28273 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt14.3□□□□□ -0.12
OXP1P28273 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.29□□□□□ -0.12
OXP1P28273 URE2YNL229C 1065 nt14.29□□□□□ -0.12
OXP1P28273 YMR057CYMR057C 372 nt14.28□□□□□ -0.12
OXP1P28273 SHR5YOL110W 714 nt14.23□□□□□ -0.13
OXP1P28273 POA1YBR022W 534 nt14.21□□□□□ -0.13
OXP1P28273 PET122YER153C 765 nt14.2□□□□□ -0.14
OXP1P28273 YJL107CYJL107C 1164 nt14.18□□□□□ -0.14
OXP1P28273 SAH1YER043C 1350 nt14.18□□□□□ -0.14
OXP1P28273 URN1YPR152C 1398 nt14.17□□□□□ -0.14
OXP1P28273 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.14□□□□□ -0.15
OXP1P28273 KTR3YBR205W 1215 nt14.14□□□□□ -0.15
OXP1P28273 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt14.1□□□□□ -0.15
OXP1P28273 OPI9YLR338W 858 nt14.09□□□□□ -0.15
OXP1P28273 RSM23YGL129C 1353 nt14.09□□□□□ -0.15
OXP1P28273 SPT5YML010W 3192 nt14.08□□□□□ -0.16
OXP1P28273 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
OXP1P28273 NEM1YHR004C 1341 nt14.05□□□□□ -0.16
OXP1P28273 DEP1YAL013W 1218 nt14.03□□□□□ -0.16
OXP1P28273 THP3YPR045C 1413 nt14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms