Protein–RNA interactions for Protein: P53924

DMA2, E3 ubiquitin-protein ligase DMA2, yeastyeast

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DMA2P53924 Q0182Q0182 405 nt18.97■□□□□ 0.63
DMA2P53924 MOT3YMR070W 1473 nt18.58■□□□□ 0.57
DMA2P53924 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.3■□□□□ 0.36
DMA2P53924 NOP1YDL014W 984 nt17.03■□□□□ 0.32
DMA2P53924 NSR1YGR159C 1245 nt16.95■□□□□ 0.3
DMA2P53924 YKL036CYKL036C 393 nt16.04■□□□□ 0.16
DMA2P53924 NME1NME1 340 nt15.24■□□□□ 0.03
DMA2P53924 MDJ1YFL016C 1536 nt15.17■□□□□ 0.02
DMA2P53924 YJL027CYJL027C 417 nt15.04■□□□□ -0
DMA2P53924 SSA1YAL005C 1929 nt15□□□□□ -0.01
DMA2P53924 Q0297Q0297 156 nt15□□□□□ -0.01
DMA2P53924 SRX1YKL086W 384 nt14.85□□□□□ -0.03
DMA2P53924 SCS3YGL126W 1143 nt14.77□□□□□ -0.05
DMA2P53924 YCR051WYCR051W 669 nt14.1□□□□□ -0.15
DMA2P53924 YGR139WYGR139W 339 nt13.97□□□□□ -0.17
DMA2P53924 FRE6YLL051C 2139 nt13.87□□□□□ -0.19
DMA2P53924 YOL085CYOL085C 342 nt13.86□□□□□ -0.19
DMA2P53924 MET8YBR213W 825 nt13.71□□□□□ -0.21
DMA2P53924 CLB6YGR109C 1143 nt13.64□□□□□ -0.23
DMA2P53924 SCJ1YMR214W 1134 nt13.62□□□□□ -0.23
DMA2P53924 Q0010Q0010 387 nt13.6□□□□□ -0.23
DMA2P53924 PKP1YIL042C 1185 nt13.57□□□□□ -0.24
DMA2P53924 FPS1YLL043W 2010 nt13.57□□□□□ -0.24
DMA2P53924 RPM1RPM1 483 nt13.5□□□□□ -0.25
DMA2P53924 RPP1BYDL130W 321 nt13.46□□□□□ -0.25
DMA2P53924 CSM2YIL132C 642 nt13.42□□□□□ -0.26
DMA2P53924 YJR154WYJR154W 1041 nt13.37□□□□□ -0.27
DMA2P53924 ATS1YAL020C 1002 nt13.32□□□□□ -0.28
DMA2P53924 DBP2YNL112W 1641 nt13.24□□□□□ -0.29
DMA2P53924 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.19□□□□□ -0.3
DMA2P53924 CCC1YLR220W 969 nt13.05□□□□□ -0.32
DMA2P53924 YBR190WYBR190W 312 nt12.96□□□□□ -0.33
DMA2P53924 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt12.91□□□□□ -0.34
DMA2P53924 PAU21YOR394W 495 nt12.89□□□□□ -0.35
DMA2P53924 PAU22YPL282C 495 nt12.89□□□□□ -0.35
DMA2P53924 PAB1YER165W 1734 nt12.88□□□□□ -0.35
DMA2P53924 SSA3YBL075C 1950 nt12.87□□□□□ -0.35
DMA2P53924 RTC3YHR087W 336 nt12.83□□□□□ -0.36
DMA2P53924 SCR1SCR1 522 nt12.81□□□□□ -0.36
DMA2P53924 PET122YER153C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
DMA2P53924 RSC4YKR008W 1878 nt12.74□□□□□ -0.37
DMA2P53924 NVJ2YPR091C 2313 nt12.72□□□□□ -0.37
DMA2P53924 BSP1YPR171W 1731 nt12.69□□□□□ -0.38
DMA2P53924 ARO7YPR060C 771 nt12.68□□□□□ -0.38
DMA2P53924 RVS167YDR388W 1449 nt12.65□□□□□ -0.38
DMA2P53924 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.64□□□□□ -0.39
DMA2P53924 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.6□□□□□ -0.39
DMA2P53924 MAS1YLR163C 1389 nt12.47□□□□□ -0.41
DMA2P53924 RRN5YLR141W 1092 nt12.46□□□□□ -0.41
DMA2P53924 YPL041CYPL041C 624 nt12.44□□□□□ -0.42
DMA2P53924 XDJ1YLR090W 1380 nt12.43□□□□□ -0.42
DMA2P53924 NAS6YGR232W 687 nt12.41□□□□□ -0.42
DMA2P53924 LCP5YER127W 1074 nt12.4□□□□□ -0.42
DMA2P53924 SSN3YPL042C 1668 nt12.39□□□□□ -0.43
DMA2P53924 URH1YDR400W 1023 nt12.39□□□□□ -0.43
DMA2P53924 COG1YGL223C 1254 nt12.33□□□□□ -0.44
DMA2P53924 RSB1YOR049C 1065 nt12.33□□□□□ -0.44
DMA2P53924 MCM5YLR274W 2328 nt12.31□□□□□ -0.44
DMA2P53924 PST2YDR032C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
DMA2P53924 YDR306CYDR306C 1437 nt12.24□□□□□ -0.45
DMA2P53924 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.22□□□□□ -0.45
DMA2P53924 YDJ1YNL064C 1230 nt12.21□□□□□ -0.45
DMA2P53924 PUS7YOR243C 2031 nt12.18□□□□□ -0.46
DMA2P53924 YJL118WYJL118W 660 nt12.16□□□□□ -0.46
DMA2P53924 FTH1YBR207W 1398 nt12.16□□□□□ -0.46
DMA2P53924 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.15□□□□□ -0.46
DMA2P53924 YLR122CYLR122C 378 nt12.15□□□□□ -0.46
DMA2P53924 YNL115CYNL115C 1935 nt12.13□□□□□ -0.47
DMA2P53924 TOM20YGR082W 552 nt12.11□□□□□ -0.47
DMA2P53924 REG2YBR050C 1017 nt12.11□□□□□ -0.47
DMA2P53924 UBX6YJL048C 1191 nt12.1□□□□□ -0.47
DMA2P53924 SHR5YOL110W 714 nt12.07□□□□□ -0.48
DMA2P53924 FAF1YIL019W 1041 nt12.06□□□□□ -0.48
DMA2P53924 ARA2YMR041C 1008 nt12.06□□□□□ -0.48
DMA2P53924 YKL097CYKL097C 411 nt12.01□□□□□ -0.49
DMA2P53924 YTH1YPR107C 627 nt11.97□□□□□ -0.49
DMA2P53924 PUS5YLR165C 765 nt11.94□□□□□ -0.5
DMA2P53924 FHN1YGR131W 525 nt11.93□□□□□ -0.5
DMA2P53924 DEP1YAL013W 1218 nt11.87□□□□□ -0.51
DMA2P53924 URN1YPR152C 1398 nt11.86□□□□□ -0.51
DMA2P53924 GAR1YHR089C 618 nt11.84□□□□□ -0.51
DMA2P53924 YMR057CYMR057C 372 nt11.82□□□□□ -0.52
DMA2P53924 KDX1YKL161C 1302 nt11.82□□□□□ -0.52
DMA2P53924 PUT4YOR348C 1884 nt11.76□□□□□ -0.53
DMA2P53924 RMA1YKL132C 1293 nt11.73□□□□□ -0.53
DMA2P53924 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
DMA2P53924 ATG17YLR423C 1254 nt11.7□□□□□ -0.54
DMA2P53924 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.68□□□□□ -0.54
DMA2P53924 BNS1YGR230W 414 nt11.67□□□□□ -0.54
DMA2P53924 ABZ2YMR289W 1125 nt11.67□□□□□ -0.54
DMA2P53924 SHU1YHL006C 453 nt11.66□□□□□ -0.54
DMA2P53924 STB1YNL309W 1263 nt11.66□□□□□ -0.54
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