Protein–RNA interactions for Protein: P53094

MDS3, Negative regulator of sporulation MDS3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3P53094 YML009W-BYML009W-B 477 nt35.19■■■■□ 3.22
MDS3P53094 NOP1YDL014W 984 nt34.17■■■■□ 3.06
MDS3P53094 NSR1YGR159C 1245 nt33.44■■■□□ 2.94
MDS3P53094 YKL036CYKL036C 393 nt32.83■■■□□ 2.85
MDS3P53094 YJL027CYJL027C 417 nt30.89■■■□□ 2.54
MDS3P53094 SCS3YGL126W 1143 nt30.68■■■□□ 2.5
MDS3P53094 Q0297Q0297 156 nt30.39■■■□□ 2.46
MDS3P53094 SRX1YKL086W 384 nt30.05■■■□□ 2.4
MDS3P53094 MDJ1YFL016C 1536 nt29.2■■■□□ 2.26
MDS3P53094 YCR051WYCR051W 669 nt28.73■■■□□ 2.19
MDS3P53094 YOL085CYOL085C 342 nt28.34■■■□□ 2.13
MDS3P53094 SCJ1YMR214W 1134 nt28.17■■■□□ 2.1
MDS3P53094 PKP1YIL042C 1185 nt28.08■■■□□ 2.09
MDS3P53094 ATS1YAL020C 1002 nt27.51■■□□□ 1.99
MDS3P53094 RPP1BYDL130W 321 nt27.31■■□□□ 1.96
MDS3P53094 TRN1tP(UGG)A 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 SUF9tP(UGG)F 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 SUF8tP(UGG)H 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 SUF7tP(UGG)M 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 SUF11tP(UGG)O2 72 nt26.65■■□□□ 1.86
MDS3P53094 CCC1YLR220W 969 nt26.37■■□□□ 1.81
MDS3P53094 PET122YER153C 765 nt26.21■■□□□ 1.79
MDS3P53094 DBP2YNL112W 1641 nt26.12■■□□□ 1.77
MDS3P53094 SCR1SCR1 522 nt25.98■■□□□ 1.75
MDS3P53094 RTC3YHR087W 336 nt25.92■■□□□ 1.74
MDS3P53094 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt25.49■■□□□ 1.67
MDS3P53094 RRN5YLR141W 1092 nt25.34■■□□□ 1.65
MDS3P53094 RSB1YOR049C 1065 nt25.34■■□□□ 1.65
MDS3P53094 PST2YDR032C 597 nt25.21■■□□□ 1.63
MDS3P53094 YKL097CYKL097C 411 nt25.01■■□□□ 1.59
MDS3P53094 YER088W-BYER088W-B 147 nt24.89■■□□□ 1.58
MDS3P53094 RVS167YDR388W 1449 nt24.66■■□□□ 1.54
MDS3P53094 YDJ1YNL064C 1230 nt24.48■■□□□ 1.51
MDS3P53094 SHU1YHL006C 453 nt24.17■■□□□ 1.46
MDS3P53094 YBR190WYBR190W 312 nt24.16■■□□□ 1.46
MDS3P53094 SHR5YOL110W 714 nt24.13■■□□□ 1.45
MDS3P53094 GAR1YHR089C 618 nt23.97■■□□□ 1.43
MDS3P53094 YOR139CYOR139C 393 nt23.88■■□□□ 1.41
MDS3P53094 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt23.52■■□□□ 1.36
MDS3P53094 NPL3YDR432W 1245 nt23.36■■□□□ 1.33
MDS3P53094 DEP1YAL013W 1218 nt23.3■■□□□ 1.32
MDS3P53094 TIR1YER011W 765 nt23.06■■□□□ 1.28
MDS3P53094 MNP1YGL068W 585 nt22.91■■□□□ 1.26
MDS3P53094 URN1YPR152C 1398 nt22.85■■□□□ 1.25
MDS3P53094 SRB2YHR041C 633 nt22.73■■□□□ 1.23
MDS3P53094 YNL208WYNL208W 600 nt22.73■■□□□ 1.23
MDS3P53094 RPN10YHR200W 807 nt22.69■■□□□ 1.22
MDS3P53094 YOL037CYOL037C 354 nt22.66■■□□□ 1.22
MDS3P53094 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt22.64■■□□□ 1.21
MDS3P53094 IMT4tM(CAU)E 72 nt22.64■■□□□ 1.21
MDS3P53094 IMT3tM(CAU)J3 72 nt22.64■■□□□ 1.21
MDS3P53094 IMT1tM(CAU)O1 72 nt22.64■■□□□ 1.21
MDS3P53094 IMT2tM(CAU)P 72 nt22.64■■□□□ 1.21
MDS3P53094 SSA1YAL005C 1929 nt22.62■■□□□ 1.21
MDS3P53094 HOM6YJR139C 1080 nt22.51■■□□□ 1.19
MDS3P53094 MOT3YMR070W 1473 nt22.44■■□□□ 1.18
MDS3P53094 YGR021WYGR021W 873 nt22.41■■□□□ 1.18
MDS3P53094 BSC6YOL137W 1494 nt22.39■■□□□ 1.18
MDS3P53094 WWM1YFL010C 636 nt22.37■■□□□ 1.17
MDS3P53094 RKM5YLR137W 1104 nt22.18■■□□□ 1.14
MDS3P53094 PUS2YGL063W 1113 nt22.15■■□□□ 1.14
MDS3P53094 OPI9YLR338W 858 nt22.11■■□□□ 1.13
MDS3P53094 YJR120WYJR120W 351 nt21.96■■□□□ 1.11
MDS3P53094 YLR281CYLR281C 468 nt21.9■■□□□ 1.1
MDS3P53094 SAH1YER043C 1350 nt21.85■■□□□ 1.09
MDS3P53094 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt21.83■■□□□ 1.08
MDS3P53094 FMP45YDL222C 930 nt21.77■■□□□ 1.08
MDS3P53094 YJR018WYJR018W 363 nt21.75■■□□□ 1.07
MDS3P53094 WHI5YOR083W 888 nt21.73■■□□□ 1.07
MDS3P53094 UBX6YJL048C 1191 nt21.67■■□□□ 1.06
MDS3P53094 MRPL8YJL063C 717 nt21.67■■□□□ 1.06
MDS3P53094 YLR236CYLR236C 324 nt21.66■■□□□ 1.06
MDS3P53094 SSA3YBL075C 1950 nt21.65■■□□□ 1.06
MDS3P53094 RPP2BYDR382W 333 nt21.55■■□□□ 1.04
MDS3P53094 YPR011CYPR011C 981 nt21.55■■□□□ 1.04
MDS3P53094 PUN1YLR414C 792 nt21.46■■□□□ 1.03
MDS3P53094 DSK2YMR276W 1122 nt21.45■■□□□ 1.03
MDS3P53094 YCH1YGR203W 447 nt21.41■■□□□ 1.02
MDS3P53094 BDH2YAL061W 1254 nt21.39■■□□□ 1.01
MDS3P53094 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt21.31■■□□□ 1
MDS3P53094 YEL076CYEL076C 651 nt21.31■■□□□ 1
MDS3P53094 ADO1YJR105W 1023 nt21.31■■□□□ 1
MDS3P53094 YLR464WYLR464W 651 nt21.31■■□□□ 1
MDS3P53094 ARE1YCR048W 1833 nt21.24■□□□□ 0.99
MDS3P53094 SPP1YPL138C 1062 nt21.2■□□□□ 0.98
MDS3P53094 PUT4YOR348C 1884 nt21.19■□□□□ 0.98
MDS3P53094 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.18■□□□□ 0.98
MDS3P53094 RTG1YOL067C 534 nt21.15■□□□□ 0.98
MDS3P53094 LPX1YOR084W 1164 nt21.14■□□□□ 0.98
MDS3P53094 LSM3YLR438C-A 270 nt21.07■□□□□ 0.96
MDS3P53094 IMP2'YIL154C 1041 nt21.06■□□□□ 0.96
MDS3P53094 PTC2YER089C 1395 nt21.06■□□□□ 0.96
MDS3P53094 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20.97■□□□□ 0.95
MDS3P53094 YBL100CYBL100C 315 nt20.94■□□□□ 0.94
MDS3P53094 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt20.93■□□□□ 0.94
MDS3P53094 ERV46YAL042W 1248 nt20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms