Protein–RNA interactions for Protein: P38873

KOG1, Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1, yeastyeast

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Length 1,557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KOG1P38873 YML009W-BYML009W-B 477 nt37.08■■■■□ 3.53
KOG1P38873 NOP1YDL014W 984 nt36.15■■■■□ 3.38
KOG1P38873 NSR1YGR159C 1245 nt35.05■■■■□ 3.2
KOG1P38873 YKL036CYKL036C 393 nt34.95■■■■□ 3.18
KOG1P38873 YJL027CYJL027C 417 nt32.91■■■□□ 2.86
KOG1P38873 SCS3YGL126W 1143 nt32.72■■■□□ 2.83
KOG1P38873 Q0297Q0297 156 nt32.21■■■□□ 2.75
KOG1P38873 SRX1YKL086W 384 nt31.8■■■□□ 2.68
KOG1P38873 SCJ1YMR214W 1134 nt30.42■■■□□ 2.46
KOG1P38873 YCR051WYCR051W 669 nt30.41■■■□□ 2.46
KOG1P38873 MDJ1YFL016C 1536 nt30.27■■■□□ 2.44
KOG1P38873 YOL085CYOL085C 342 nt30.11■■■□□ 2.41
KOG1P38873 PKP1YIL042C 1185 nt29.79■■■□□ 2.36
KOG1P38873 ATS1YAL020C 1002 nt29.43■■■□□ 2.3
KOG1P38873 RPP1BYDL130W 321 nt28.93■■■□□ 2.22
KOG1P38873 TRN1tP(UGG)A 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 SUF9tP(UGG)F 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 SUF8tP(UGG)H 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 SUF7tP(UGG)M 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 SUF11tP(UGG)O2 72 nt27.99■■■□□ 2.07
KOG1P38873 RTC3YHR087W 336 nt27.93■■■□□ 2.06
KOG1P38873 CCC1YLR220W 969 nt27.73■■■□□ 2.03
KOG1P38873 PET122YER153C 765 nt27.69■■■□□ 2.02
KOG1P38873 SCR1SCR1 522 nt27.62■■■□□ 2.01
KOG1P38873 DBP2YNL112W 1641 nt27.18■■□□□ 1.94
KOG1P38873 PST2YDR032C 597 nt26.94■■□□□ 1.9
KOG1P38873 RSB1YOR049C 1065 nt26.93■■□□□ 1.9
KOG1P38873 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt26.88■■□□□ 1.89
KOG1P38873 YKL097CYKL097C 411 nt26.87■■□□□ 1.89
KOG1P38873 RRN5YLR141W 1092 nt26.84■■□□□ 1.89
KOG1P38873 YER088W-BYER088W-B 147 nt26.36■■□□□ 1.81
KOG1P38873 RVS167YDR388W 1449 nt25.83■■□□□ 1.73
KOG1P38873 YDJ1YNL064C 1230 nt25.82■■□□□ 1.72
KOG1P38873 SHU1YHL006C 453 nt25.73■■□□□ 1.71
KOG1P38873 YOR139CYOR139C 393 nt25.56■■□□□ 1.68
KOG1P38873 SHR5YOL110W 714 nt25.29■■□□□ 1.64
KOG1P38873 GAR1YHR089C 618 nt25.23■■□□□ 1.63
KOG1P38873 YBR190WYBR190W 312 nt25.05■■□□□ 1.6
KOG1P38873 NPL3YDR432W 1245 nt25.01■■□□□ 1.59
KOG1P38873 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt25■■□□□ 1.59
KOG1P38873 BSC6YOL137W 1494 nt24.36■■□□□ 1.49
KOG1P38873 DEP1YAL013W 1218 nt24.32■■□□□ 1.48
KOG1P38873 TIR1YER011W 765 nt24.26■■□□□ 1.47
KOG1P38873 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt24.22■■□□□ 1.47
KOG1P38873 IMT4tM(CAU)E 72 nt24.22■■□□□ 1.47
KOG1P38873 IMT3tM(CAU)J3 72 nt24.22■■□□□ 1.47
KOG1P38873 IMT1tM(CAU)O1 72 nt24.22■■□□□ 1.47
KOG1P38873 IMT2tM(CAU)P 72 nt24.22■■□□□ 1.47
KOG1P38873 MNP1YGL068W 585 nt24.2■■□□□ 1.47
KOG1P38873 RPN10YHR200W 807 nt24.11■■□□□ 1.45
KOG1P38873 YOL037CYOL037C 354 nt24.11■■□□□ 1.45
KOG1P38873 MOT3YMR070W 1473 nt24.09■■□□□ 1.45
KOG1P38873 URN1YPR152C 1398 nt23.8■■□□□ 1.4
KOG1P38873 SRB2YHR041C 633 nt23.79■■□□□ 1.4
KOG1P38873 HOM6YJR139C 1080 nt23.79■■□□□ 1.4
KOG1P38873 YNL208WYNL208W 600 nt23.78■■□□□ 1.4
KOG1P38873 YGR021WYGR021W 873 nt23.74■■□□□ 1.39
KOG1P38873 SSA1YAL005C 1929 nt23.7■■□□□ 1.38
KOG1P38873 PUS2YGL063W 1113 nt23.65■■□□□ 1.38
KOG1P38873 WWM1YFL010C 636 nt23.58■■□□□ 1.37
KOG1P38873 UBX6YJL048C 1191 nt23.44■■□□□ 1.34
KOG1P38873 RKM5YLR137W 1104 nt23.44■■□□□ 1.34
KOG1P38873 MRPL8YJL063C 717 nt23.42■■□□□ 1.34
KOG1P38873 YLR281CYLR281C 468 nt23.3■■□□□ 1.32
KOG1P38873 FMP45YDL222C 930 nt23.2■■□□□ 1.3
KOG1P38873 WHI5YOR083W 888 nt23.08■■□□□ 1.29
KOG1P38873 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt23.02■■□□□ 1.28
KOG1P38873 ADO1YJR105W 1023 nt23.01■■□□□ 1.27
KOG1P38873 OPI9YLR338W 858 nt22.97■■□□□ 1.27
KOG1P38873 YLR236CYLR236C 324 nt22.92■■□□□ 1.26
KOG1P38873 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt22.88■■□□□ 1.25
KOG1P38873 YEL076CYEL076C 651 nt22.88■■□□□ 1.25
KOG1P38873 YLR464WYLR464W 651 nt22.88■■□□□ 1.25
KOG1P38873 YCH1YGR203W 447 nt22.87■■□□□ 1.25
KOG1P38873 YPR011CYPR011C 981 nt22.85■■□□□ 1.25
KOG1P38873 YJR120WYJR120W 351 nt22.84■■□□□ 1.25
KOG1P38873 DSK2YMR276W 1122 nt22.8■■□□□ 1.24
KOG1P38873 YJR018WYJR018W 363 nt22.68■■□□□ 1.22
KOG1P38873 RTG1YOL067C 534 nt22.63■■□□□ 1.21
KOG1P38873 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt22.62■■□□□ 1.21
KOG1P38873 SSA3YBL075C 1950 nt22.61■■□□□ 1.21
KOG1P38873 SAH1YER043C 1350 nt22.61■■□□□ 1.21
KOG1P38873 RPP2BYDR382W 333 nt22.59■■□□□ 1.21
KOG1P38873 SPP1YPL138C 1062 nt22.51■■□□□ 1.19
KOG1P38873 YDR094WYDR094W 336 nt22.44■■□□□ 1.18
KOG1P38873 IMP2'YIL154C 1041 nt22.44■■□□□ 1.18
KOG1P38873 BDH2YAL061W 1254 nt22.42■■□□□ 1.18
KOG1P38873 LPX1YOR084W 1164 nt22.39■■□□□ 1.18
KOG1P38873 PUN1YLR414C 792 nt22.31■■□□□ 1.16
KOG1P38873 SIS1YNL007C 1059 nt22.3■■□□□ 1.16
KOG1P38873 SBA1YKL117W 651 nt22.26■■□□□ 1.15
KOG1P38873 LSM3YLR438C-A 270 nt22.15■■□□□ 1.14
KOG1P38873 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt22.12■■□□□ 1.13
KOG1P38873 ERV46YAL042W 1248 nt22.09■■□□□ 1.13
KOG1P38873 HUA1YGR268C 597 nt22.01■■□□□ 1.11
KOG1P38873 ARE1YCR048W 1833 nt21.84■■□□□ 1.09
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