RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CHD1O14646 1710 aa44.38■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRIN2AQ12879 1464 aa44.35■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.32■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.24■■■■■ 4.67
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP170Q5SW79 1584 aa44.07■■■■■ 4.65
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K1Q13233 1512 aa43.79■■■■■ 4.6
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.63■■■■■ 4.58
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGEF11O15085 1522 aa43.48■■■■■ 4.55
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.43■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.43■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.4■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 DISP1Q96F81 1524 aa43.39■■■■■ 4.54
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0556O60303 1618 aa43.32■■■■■ 4.52
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPRGP23470 1445 aa43.15■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 HECW1Q76N89 1606 aa43.14■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.11■■■■■ 4.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.11■■■■■ 4.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.06■■■■■ 4.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.99■■■■■ 4.47
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.9■■■■■ 4.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.86■■■■■ 4.45
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.441e-25■■■■□ 20
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NCOA2Q15596 1464 aa42.77■■■■■ 4.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCC2Q92887 1545 aa42.75■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.74■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.74■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.69■■■■■ 4.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP10BO94823 1461 aa42.47■■■■■ 4.39
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.42■■■■■ 4.38
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.24■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPRKQ15262 1439 aa42.21■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.2■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF14Q15058 1648 aa42.17■■■■■ 4.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.16■■■■■ 4.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 HFM1A2PYH4 1435 aa42.13■■■■■ 4.33
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNH8Q96L42 1107 aa42.12■■■■■ 4.33
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