RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.52■■■■■ 4.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARAP1Q96P48 1450 aa44.39■■■■■ 4.7
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHD1O14646 1710 aa44.38■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRIN2AQ12879 1464 aa44.35■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.32■■■■■ 4.69
CTDNEP1-210ENST00000574322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSCARQ8IYS5 282 aa44.25■■■■■ 4.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.24■■■■■ 4.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUP160Q12769 1436 aa44.1■■■■■ 4.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP170Q5SW79 1584 aa44.07■■■■■ 4.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.07■■■■■ 4.64
CTDNEP1-210ENST00000574322 APLP2Q06481 763 aa43.98■■■■■ 4.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 SAMD9Q5K651 1589 aa43.85■■■■■ 4.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K1Q13233 1512 aa43.79■■■■■ 4.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 HRCP23327 699 aa43.76■■■■■ 4.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 IQGAP2Q13576 1575 aa43.75■■■■■ 4.59
CTDNEP1-210ENST00000574322 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.73■■■■■ 4.59
CTDNEP1-210ENST00000574322 JPH4Q96JJ6 628 aa43.73■■■■■ 4.59
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
CTDNEP1-210ENST00000574322 FMN1Q68DA7 1419 aa43.65■■■■■ 4.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 P3H3Q8IVL6 736 aa43.63■■■■■ 4.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.63■■■■■ 4.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHROOM2Q13796 1616 aa43.62■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.61■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.61■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIAM1Q13009 1591 aa43.6■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.58■■■■■ 4.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.51■■■■■ 4.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGEF11O15085 1522 aa43.48■■■■■ 4.55
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.43■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.43■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.4■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 DISP1Q96F81 1524 aa43.39■■■■■ 4.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0556O60303 1618 aa43.32■■■■■ 4.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.19■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPRGP23470 1445 aa43.15■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 HECW1Q76N89 1606 aa43.14■■■■■ 4.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.11■■■■■ 4.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.11■■■■■ 4.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.06■■■■■ 4.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.99■■■■■ 4.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.94■■■■■ 4.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.94■■■■■ 4.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.9■■■■■ 4.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 UACAQ9BZF9 1416 aa42.87■■■■■ 4.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.86■■■■■ 4.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.82■■■■■ 4.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.441e-25■■■■□ 20
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCA8O94911 1581 aa42.78■■■■■ 4.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCOA2Q15596 1464 aa42.77■■■■■ 4.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCC2Q92887 1545 aa42.75■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.74■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.74■■■■■ 4.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.69■■■■■ 4.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARID3CA6NKF2 412 aa42.6■■■■■ 4.41
CTDNEP1-210ENST00000574322 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.54■■■■■ 4.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP10BO94823 1461 aa42.47■■■■■ 4.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 MIA2Q96PC5 1412 aa42.44■■■■■ 4.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.42■■■■■ 4.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITGAEP38570 1179 aa42.42■■■■■ 4.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.34■■■■■ 4.37
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.32■■■■■ 4.37
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAPKBP1O60336 1514 aa42.31■■■■■ 4.36
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASXL2Q76L83 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
CTDNEP1-210ENST00000574322 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.27■■■■■ 4.36
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.24■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPRKQ15262 1439 aa42.21■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.2■■■■■ 4.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF14Q15058 1648 aa42.17■■■■■ 4.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.16■■■■■ 4.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 HFM1A2PYH4 1435 aa42.13■■■■■ 4.33
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNH8Q96L42 1107 aa42.12■■■■■ 4.33
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