Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.286e-121■■■■■ 2049.7
DROSHAQ9NRR4 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.263e-87■■■■■ 886.2
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 321.51■■□□□ 1.038e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 313.96□□□□□ -0.188e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.371e-26■■■■■ 532.8
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 321.97■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 469.5
DROSHAQ9NRR4 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.334e-62■■■■■ 439.2
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.619e-25■■■■■ 436.8
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7I-201ENST00000362309 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.49e-30■■■■■ 433.4
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.168e-25■■■■■ 428.2
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)23.77■■□□□ 1.48e-25■■■■■ 428.2
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 375.6
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 375.6
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 368.3
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 435.1■■■■□ 3.213e-7■■■■■ 355.2
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.73e-7■■■■■ 355.2
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 518.11■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 322.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 322.9
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 328.43■■■□□ 2.144e-7■■■■■ 320.3
DROSHAQ9NRR4 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.674e-18■■■■■ 304.4
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.972e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-215ENST00000586268 830 ntTSL 321.23■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-235ENST00000592601 551 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-219ENST00000587634 628 ntTSL 417.35■□□□□ 0.372e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-221ENST00000588066 579 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 43.24□□□□□ -1.892e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.581e-23■■■■■ 283.6
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.537e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 221.23■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-23■■■■■ 262
DROSHAQ9NRR4 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.97e-14■■■■■ 250.8
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.852e-46■■■■■ 248.1
DROSHAQ9NRR4 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.391e-24■■■■■ 247
DROSHAQ9NRR4 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.371e-97■■■■■ 242.2
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 421.33■■□□□ 13e-7■■■■■ 231.4
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 231.4
DROSHAQ9NRR4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 18e-19■■■■■ 229.3
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-210ENST00000597572 660 ntTSL 526.1■■□□□ 1.772e-45■■■■■ 227.3
DROSHAQ9NRR4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81e-323■■■■■ 217.3
DROSHAQ9NRR4 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 223.37■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 214.3
DROSHAQ9NRR4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.582e-37■■■■■ 209
DROSHAQ9NRR4 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.042e-51■■■■■ 208.7
DROSHAQ9NRR4 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.393e-76■■■■■ 206.2
DROSHAQ9NRR4 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.114e-181■■■■■ 205.6
DROSHAQ9NRR4 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 331.56■■■□□ 2.646e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 528.83■■■□□ 2.216e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.086e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.916e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 525.88■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 524.77■■□□□ 1.566e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-56■■■■■ 201.8
DROSHAQ9NRR4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.724e-166■■■■■ 200
DROSHAQ9NRR4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.56■■■□□ 2.961e-323■■■■■ 196.4
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 424.18■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 192.9
DROSHAQ9NRR4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.323e-80■■■■■ 186.5
DROSHAQ9NRR4 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.132e-24■■■■■ 186.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.751e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.474e-28■■■■■ 184.5
DROSHAQ9NRR4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.8■■□□□ 1.561e-34■■■■■ 178.9
DROSHAQ9NRR4 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC12.7□□□□□ -0.388e-21■■■■■ 177.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.511e-42■■■■■ 174.2
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 230.89■■■□□ 2.541e-42■■■■■ 170.5
DROSHAQ9NRR4 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.261e-43■■■■■ 169
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-206ENST00000514611 1139 ntTSL 220.81■□□□□ 0.921e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-205ENST00000512925 900 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-204ENST00000512707 798 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-203ENST00000510217 1091 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 328■■■□□ 2.071e-42■■■■■ 166.3
DROSHAQ9NRR4 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC10.99□□□□□ -0.658e-29■■■■■ 166.2
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.138e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 224.3■■□□□ 1.488e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.338e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 519.91■□□□□ 0.788e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 513.83□□□□□ -0.198e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 DIP2C-203ENST00000421992 757 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 162.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.491e-42■■■■■ 160.8
Retrieved 100 of 16,331 protein–RNA pairs in 65.3 ms