Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.99■■■■■ 6.39
RAPGEF6Q8TEU7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.49■■■■■ 6.31
RAPGEF6Q8TEU7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.74■■■■■ 6.19
RAPGEF6Q8TEU7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.66■■■■■ 6.18
RAPGEF6Q8TEU7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
RAPGEF6Q8TEU7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.9■■■■■ 6.06
RAPGEF6Q8TEU7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
RAPGEF6Q8TEU7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.48■■■■■ 5.99
RAPGEF6Q8TEU7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.12■■■■■ 5.93
RAPGEF6Q8TEU7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.01■■■■■ 5.92
RAPGEF6Q8TEU7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.89■■■■■ 5.9
RAPGEF6Q8TEU7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
RAPGEF6Q8TEU7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
RAPGEF6Q8TEU7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
RAPGEF6Q8TEU7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.39■■■■■ 5.82
RAPGEF6Q8TEU7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
RAPGEF6Q8TEU7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
RAPGEF6Q8TEU7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
RAPGEF6Q8TEU7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
RAPGEF6Q8TEU7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.73■■■■■ 5.71
RAPGEF6Q8TEU7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
RAPGEF6Q8TEU7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
RAPGEF6Q8TEU7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
RAPGEF6Q8TEU7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
RAPGEF6Q8TEU7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
RAPGEF6Q8TEU7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.29■■■■■ 5.64
RAPGEF6Q8TEU7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
RAPGEF6Q8TEU7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
RAPGEF6Q8TEU7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
RAPGEF6Q8TEU7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
RAPGEF6Q8TEU7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.6
RAPGEF6Q8TEU7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
RAPGEF6Q8TEU7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
RAPGEF6Q8TEU7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
RAPGEF6Q8TEU7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
RAPGEF6Q8TEU7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
RAPGEF6Q8TEU7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
RAPGEF6Q8TEU7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.3■■■■■ 5.48
RAPGEF6Q8TEU7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
RAPGEF6Q8TEU7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.42
RAPGEF6Q8TEU7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RAPGEF6Q8TEU7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RAPGEF6Q8TEU7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
RAPGEF6Q8TEU7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
RAPGEF6Q8TEU7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
RAPGEF6Q8TEU7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.5■■■■■ 5.35
RAPGEF6Q8TEU7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
RAPGEF6Q8TEU7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
RAPGEF6Q8TEU7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
RAPGEF6Q8TEU7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
RAPGEF6Q8TEU7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
RAPGEF6Q8TEU7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
RAPGEF6Q8TEU7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
RAPGEF6Q8TEU7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
RAPGEF6Q8TEU7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
RAPGEF6Q8TEU7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
RAPGEF6Q8TEU7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
RAPGEF6Q8TEU7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
RAPGEF6Q8TEU7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
RAPGEF6Q8TEU7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
RAPGEF6Q8TEU7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
RAPGEF6Q8TEU7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RAPGEF6Q8TEU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
RAPGEF6Q8TEU7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RAPGEF6Q8TEU7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
RAPGEF6Q8TEU7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
RAPGEF6Q8TEU7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
RAPGEF6Q8TEU7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
RAPGEF6Q8TEU7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
RAPGEF6Q8TEU7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
RAPGEF6Q8TEU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
RAPGEF6Q8TEU7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
RAPGEF6Q8TEU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
RAPGEF6Q8TEU7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
RAPGEF6Q8TEU7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
RAPGEF6Q8TEU7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.2■■■■■ 5.15
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.15
RAPGEF6Q8TEU7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
RAPGEF6Q8TEU7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
RAPGEF6Q8TEU7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
RAPGEF6Q8TEU7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
RAPGEF6Q8TEU7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
RAPGEF6Q8TEU7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.97■■■■■ 5.11
RAPGEF6Q8TEU7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
RAPGEF6Q8TEU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
RAPGEF6Q8TEU7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
RAPGEF6Q8TEU7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
RAPGEF6Q8TEU7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
RAPGEF6Q8TEU7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
RAPGEF6Q8TEU7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
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