RNA–Protein interactions for RNA: YPR003C

YPR003C, Transcript of Putative sulfate permease, yeast

Gene YPR003C, Length 2,265 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR003C	YPR003C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	MCM1	P11746	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	DAL5	P15365	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	MYO4	P32492	1471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	VPS4	P52917	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	BRL1	P38770	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	SEC9	P40357	651 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR003C	YPR003C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	TAF13	P11747	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	VPS72	Q03388	795 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	KOG1	P38873	1557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	BRN1	P38170	754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	SAM3	Q08986	587 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	PEP1	P32319	1579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	MSH3	P25336	1018 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	MLP2	P40457	1679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	GTT3	P39996	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	LAM6	Q08001	693 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	DJP1	P40564	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	VPS15	P22219	1454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YPR003C	YPR003C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	LEM3	P42838	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	RAD26	P40352	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	ATH1	P48016	1211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	GUT1	P32190	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	PEA2	P40091	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	PBS2	P08018	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	ASF1	P32447	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	LTV1	P34078	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	DMA2	P53924	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	GYP5	Q12344	894 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	ATG2	P53855	1592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	MHP1	P43638	1398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR003C	YPR003C	ROX1	P25042	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	DSF2	P38213	736 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SIC1	P38634	284 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	OSW7	P43611	510 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	YOL036W	Q08206	761 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YPR003C	YPR003C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	DNF1	P32660	1571 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	DEP1	P31385	405 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	RPO31	P04051	1460 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SEC20	P28791	383 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	CDC11	P32458	415 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SAP190	P36123	1033 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SET4	P42948	560 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	YJL171C	P46992	396 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	CTR9	P89105	1077 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	NUP159	P40477	1460 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	HOS4	P40480	1083 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	RCF1	Q03713	159 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	MSB4	Q12317	492 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	RAD51	P25454	400 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	SOL3	P38858	249 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	AIM20	P40451	204 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	PKH1	Q03407	766 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	WSC3	Q12215	556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	DCW1	P36091	449 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	PIM1	P36775	1133 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	YGR273C	P53329	174 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	FAR11	P53917	953 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR003C	YPR003C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.6 ms