Protein–RNA interactions for Protein: Q12344

GYP5, GTPase-activating protein GYP5, yeastyeast

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GYP5Q12344 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.78■■□□□ 1.56
GYP5Q12344 NSR1YGR159C 1245 nt24.43■■□□□ 1.5
GYP5Q12344 NOP1YDL014W 984 nt24.09■■□□□ 1.45
GYP5Q12344 YKL036CYKL036C 393 nt22.4■■□□□ 1.18
GYP5Q12344 MDJ1YFL016C 1536 nt21.62■■□□□ 1.05
GYP5Q12344 Q0297Q0297 156 nt21.14■□□□□ 0.97
GYP5Q12344 SRX1YKL086W 384 nt21.07■□□□□ 0.96
GYP5Q12344 YJL027CYJL027C 417 nt20.96■□□□□ 0.95
GYP5Q12344 SCS3YGL126W 1143 nt20.49■□□□□ 0.87
GYP5Q12344 YCR051WYCR051W 669 nt20.05■□□□□ 0.8
GYP5Q12344 YOL085CYOL085C 342 nt19.41■□□□□ 0.7
GYP5Q12344 DBP2YNL112W 1641 nt19.17■□□□□ 0.66
GYP5Q12344 PKP1YIL042C 1185 nt19.16■□□□□ 0.66
GYP5Q12344 RPP1BYDL130W 321 nt18.99■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.96■□□□□ 0.63
GYP5Q12344 CCC1YLR220W 969 nt18.84■□□□□ 0.61
GYP5Q12344 ATS1YAL020C 1002 nt18.35■□□□□ 0.53
GYP5Q12344 YBR190WYBR190W 312 nt18.33■□□□□ 0.52
GYP5Q12344 SCJ1YMR214W 1134 nt18.26■□□□□ 0.51
GYP5Q12344 PET122YER153C 765 nt18.16■□□□□ 0.5
GYP5Q12344 RVS167YDR388W 1449 nt18.02■□□□□ 0.48
GYP5Q12344 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.01■□□□□ 0.47
GYP5Q12344 RTC3YHR087W 336 nt17.98■□□□□ 0.47
GYP5Q12344 SCR1SCR1 522 nt17.97■□□□□ 0.47
GYP5Q12344 RRN5YLR141W 1092 nt17.65■□□□□ 0.42
GYP5Q12344 SHR5YOL110W 714 nt17.44■□□□□ 0.38
GYP5Q12344 YDJ1YNL064C 1230 nt17.38■□□□□ 0.37
GYP5Q12344 RSB1YOR049C 1065 nt17.34■□□□□ 0.37
GYP5Q12344 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.3■□□□□ 0.36
GYP5Q12344 GAR1YHR089C 618 nt17.03■□□□□ 0.32
GYP5Q12344 PST2YDR032C 597 nt16.97■□□□□ 0.31
GYP5Q12344 DEP1YAL013W 1218 nt16.97■□□□□ 0.31
GYP5Q12344 URN1YPR152C 1398 nt16.89■□□□□ 0.29
GYP5Q12344 YNL208WYNL208W 600 nt16.65■□□□□ 0.26
GYP5Q12344 RPN10YHR200W 807 nt16.62■□□□□ 0.25
GYP5Q12344 OPI9YLR338W 858 nt16.58■□□□□ 0.24
GYP5Q12344 PUT4YOR348C 1884 nt16.54■□□□□ 0.24
GYP5Q12344 YGR139WYGR139W 339 nt16.48■□□□□ 0.23
GYP5Q12344 SAH1YER043C 1350 nt16.48■□□□□ 0.23
GYP5Q12344 TIR1YER011W 765 nt16.43■□□□□ 0.22
GYP5Q12344 YKL097CYKL097C 411 nt16.39■□□□□ 0.21
GYP5Q12344 ARE1YCR048W 1833 nt16.31■□□□□ 0.2
GYP5Q12344 SHU1YHL006C 453 nt16.27■□□□□ 0.2
GYP5Q12344 SSA1YAL005C 1929 nt16.22■□□□□ 0.19
GYP5Q12344 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.11■□□□□ 0.17
GYP5Q12344 YJR018WYJR018W 363 nt16.11■□□□□ 0.17
GYP5Q12344 PUN1YLR414C 792 nt16.08■□□□□ 0.16
GYP5Q12344 POA1YBR022W 534 nt16.07■□□□□ 0.16
GYP5Q12344 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.04■□□□□ 0.16
GYP5Q12344 SRB2YHR041C 633 nt16.02■□□□□ 0.16
GYP5Q12344 YJR120WYJR120W 351 nt15.91■□□□□ 0.14
GYP5Q12344 PTC2YER089C 1395 nt15.9■□□□□ 0.14
GYP5Q12344 RPP2BYDR382W 333 nt15.8■□□□□ 0.12
GYP5Q12344 BUD23YCR047C 828 nt15.78■□□□□ 0.12
GYP5Q12344 WWM1YFL010C 636 nt15.77■□□□□ 0.12
GYP5Q12344 YOR139CYOR139C 393 nt15.73■□□□□ 0.11
GYP5Q12344 BSC6YOL137W 1494 nt15.67■□□□□ 0.1
GYP5Q12344 YGR021WYGR021W 873 nt15.65■□□□□ 0.1
GYP5Q12344 NAB2YGL122C 1578 nt15.64■□□□□ 0.09
GYP5Q12344 MNP1YGL068W 585 nt15.63■□□□□ 0.09
GYP5Q12344 HOM6YJR139C 1080 nt15.63■□□□□ 0.09
GYP5Q12344 NPL3YDR432W 1245 nt15.54■□□□□ 0.08
GYP5Q12344 BDH2YAL061W 1254 nt15.52■□□□□ 0.08
GYP5Q12344 FPR4YLR449W 1179 nt15.5■□□□□ 0.07
GYP5Q12344 INM2YDR287W 879 nt15.48■□□□□ 0.07
GYP5Q12344 DAL1YIR027C 1383 nt15.48■□□□□ 0.07
GYP5Q12344 SSA3YBL075C 1950 nt15.47■□□□□ 0.07
GYP5Q12344 MOT3YMR070W 1473 nt15.46■□□□□ 0.07
GYP5Q12344 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.45■□□□□ 0.06
GYP5Q12344 FIS1YIL065C 468 nt15.45■□□□□ 0.06
GYP5Q12344 RKM5YLR137W 1104 nt15.41■□□□□ 0.06
GYP5Q12344 YBL100CYBL100C 315 nt15.4■□□□□ 0.06
GYP5Q12344 Q0182Q0182 405 nt15.39■□□□□ 0.05
GYP5Q12344 YOL037CYOL037C 354 nt15.36■□□□□ 0.05
GYP5Q12344 PHO4YFR034C 939 nt15.34■□□□□ 0.05
GYP5Q12344 LSM3YLR438C-A 270 nt15.33■□□□□ 0.04
GYP5Q12344 FUN26YAL022C 1554 nt15.21■□□□□ 0.03
GYP5Q12344 TRM9YML014W 840 nt15.21■□□□□ 0.03
GYP5Q12344 NME1NME1 340 nt15.14■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GYP5Q12344 CCT6YDR188W 1641 nt15.03■□□□□ -0
GYP5Q12344 YLR281CYLR281C 468 nt15.02■□□□□ -0
GYP5Q12344 YPS1YLR120C 1710 nt14.97□□□□□ -0.01
GYP5Q12344 WHI5YOR083W 888 nt14.97□□□□□ -0.01
GYP5Q12344 PUS2YGL063W 1113 nt14.96□□□□□ -0.01
GYP5Q12344 ALF1YNL148C 765 nt14.96□□□□□ -0.01
GYP5Q12344 YDR095CYDR095C 411 nt14.9□□□□□ -0.02
GYP5Q12344 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms