Protein–RNA interactions for Protein: P46992

YJL171C, Cell wall protein YJL171C, yeastyeast

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL171CP46992 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.27■■□□□ 1.48
YJL171CP46992 NOP1YDL014W 984 nt23.67■■□□□ 1.38
YJL171CP46992 NSR1YGR159C 1245 nt23.62■■□□□ 1.37
YJL171CP46992 YKL036CYKL036C 393 nt22.3■■□□□ 1.16
YJL171CP46992 YJL027CYJL027C 417 nt20.95■□□□□ 0.94
YJL171CP46992 Q0297Q0297 156 nt20.86■□□□□ 0.93
YJL171CP46992 SRX1YKL086W 384 nt20.7■□□□□ 0.9
YJL171CP46992 MDJ1YFL016C 1536 nt20.67■□□□□ 0.9
YJL171CP46992 SCS3YGL126W 1143 nt20.55■□□□□ 0.88
YJL171CP46992 YCR051WYCR051W 669 nt19.78■□□□□ 0.76
YJL171CP46992 YOL085CYOL085C 342 nt19.33■□□□□ 0.68
YJL171CP46992 PKP1YIL042C 1185 nt19.09■□□□□ 0.65
YJL171CP46992 RPP1BYDL130W 321 nt18.75■□□□□ 0.59
YJL171CP46992 SCJ1YMR214W 1134 nt18.64■□□□□ 0.57
YJL171CP46992 ATS1YAL020C 1002 nt18.5■□□□□ 0.55
YJL171CP46992 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.44■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 CCC1YLR220W 969 nt18.42■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 DBP2YNL112W 1641 nt18.41■□□□□ 0.54
YJL171CP46992 PET122YER153C 765 nt17.91■□□□□ 0.46
YJL171CP46992 SCR1SCR1 522 nt17.8■□□□□ 0.44
YJL171CP46992 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.64■□□□□ 0.41
YJL171CP46992 RRN5YLR141W 1092 nt17.47■□□□□ 0.39
YJL171CP46992 YBR190WYBR190W 312 nt17.4■□□□□ 0.38
YJL171CP46992 RVS167YDR388W 1449 nt17.38■□□□□ 0.37
YJL171CP46992 RSB1YOR049C 1065 nt17.25■□□□□ 0.35
YJL171CP46992 RTC3YHR087W 336 nt17.16■□□□□ 0.34
YJL171CP46992 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.1■□□□□ 0.33
YJL171CP46992 PST2YDR032C 597 nt17.05■□□□□ 0.32
YJL171CP46992 YDJ1YNL064C 1230 nt16.99■□□□□ 0.31
YJL171CP46992 SHR5YOL110W 714 nt16.87■□□□□ 0.29
YJL171CP46992 GAR1YHR089C 618 nt16.67■□□□□ 0.26
YJL171CP46992 YKL097CYKL097C 411 nt16.62■□□□□ 0.25
YJL171CP46992 DEP1YAL013W 1218 nt16.4■□□□□ 0.22
YJL171CP46992 VAR1Q0140 1197 nt16.35■□□□□ 0.21
YJL171CP46992 SHU1YHL006C 453 nt16.3■□□□□ 0.2
YJL171CP46992 URN1YPR152C 1398 nt16.2■□□□□ 0.18
YJL171CP46992 YNL208WYNL208W 600 nt16.06■□□□□ 0.16
YJL171CP46992 TIR1YER011W 765 nt16.04■□□□□ 0.16
YJL171CP46992 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.02■□□□□ 0.16
YJL171CP46992 RPN10YHR200W 807 nt15.97■□□□□ 0.15
YJL171CP46992 YOR139CYOR139C 393 nt15.9■□□□□ 0.14
YJL171CP46992 YGR139WYGR139W 339 nt15.82■□□□□ 0.12
YJL171CP46992 OPI9YLR338W 858 nt15.8■□□□□ 0.12
YJL171CP46992 SSA1YAL005C 1929 nt15.78■□□□□ 0.12
YJL171CP46992 SAH1YER043C 1350 nt15.67■□□□□ 0.1
YJL171CP46992 SRB2YHR041C 633 nt15.66■□□□□ 0.1
YJL171CP46992 NPL3YDR432W 1245 nt15.65■□□□□ 0.1
YJL171CP46992 MNP1YGL068W 585 nt15.48■□□□□ 0.07
YJL171CP46992 WWM1YFL010C 636 nt15.47■□□□□ 0.07
YJL171CP46992 YJR018WYJR018W 363 nt15.47■□□□□ 0.07
YJL171CP46992 PUT4YOR348C 1884 nt15.47■□□□□ 0.07
YJL171CP46992 HOM6YJR139C 1080 nt15.4■□□□□ 0.06
YJL171CP46992 YGR021WYGR021W 873 nt15.38■□□□□ 0.05
YJL171CP46992 ARE1YCR048W 1833 nt15.36■□□□□ 0.05
YJL171CP46992 PUN1YLR414C 792 nt15.33■□□□□ 0.04
YJL171CP46992 YJR120WYJR120W 351 nt15.32■□□□□ 0.04
YJL171CP46992 YOL037CYOL037C 354 nt15.26■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 RPP2BYDR382W 333 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL171CP46992 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.18■□□□□ 0.02
YJL171CP46992 RKM5YLR137W 1104 nt15.18■□□□□ 0.02
YJL171CP46992 PTC2YER089C 1395 nt15.14■□□□□ 0.01
YJL171CP46992 POA1YBR022W 534 nt15.12■□□□□ 0.01
YJL171CP46992 Q0017Q0017 162 nt15.11■□□□□ 0.01
YJL171CP46992 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.1■□□□□ 0.01
YJL171CP46992 PUS2YGL063W 1113 nt15.01□□□□□ -0.01
YJL171CP46992 BDH2YAL061W 1254 nt15.01□□□□□ -0.01
YJL171CP46992 SSA3YBL075C 1950 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL171CP46992 BUD23YCR047C 828 nt14.93□□□□□ -0.02
YJL171CP46992 YLR281CYLR281C 468 nt14.93□□□□□ -0.02
YJL171CP46992 YDR509WYDR509W 348 nt14.86□□□□□ -0.03
YJL171CP46992 LSM3YLR438C-A 270 nt14.86□□□□□ -0.03
YJL171CP46992 WHI5YOR083W 888 nt14.86□□□□□ -0.03
YJL171CP46992 FPR4YLR449W 1179 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 NAB2YGL122C 1578 nt14.82□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 MOT3YMR070W 1473 nt14.82□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 INM2YDR287W 879 nt14.8□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 Q0142Q0142 177 nt14.78□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 YBL100CYBL100C 315 nt14.78□□□□□ -0.04
YJL171CP46992 DAL1YIR027C 1383 nt14.72□□□□□ -0.05
YJL171CP46992 TRM9YML014W 840 nt14.68□□□□□ -0.06
YJL171CP46992 FIS1YIL065C 468 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL171CP46992 YPR011CYPR011C 981 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL171CP46992 BSC6YOL137W 1494 nt14.64□□□□□ -0.07
YJL171CP46992 FMP45YDL222C 930 nt14.63□□□□□ -0.07
YJL171CP46992 FUN26YAL022C 1554 nt14.62□□□□□ -0.07
YJL171CP46992 PHO4YFR034C 939 nt14.6□□□□□ -0.07
YJL171CP46992 DSK2YMR276W 1122 nt14.55□□□□□ -0.08
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