Protein–RNA interactions for Protein: P34078

LTV1, Protein LTV1, yeastyeast

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTV1P34078 NSR1YGR159C 1245 nt21.04■□□□□ 0.96
LTV1P34078 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.46■□□□□ 0.87
LTV1P34078 NOP1YDL014W 984 nt19.53■□□□□ 0.72
LTV1P34078 MDJ1YFL016C 1536 nt19.49■□□□□ 0.71
LTV1P34078 YJL027CYJL027C 417 nt17.87■□□□□ 0.45
LTV1P34078 YKL036CYKL036C 393 nt17.26■□□□□ 0.35
LTV1P34078 SRX1YKL086W 384 nt17.07■□□□□ 0.32
LTV1P34078 SSA3YBL075C 1950 nt16.93■□□□□ 0.3
LTV1P34078 DBP2YNL112W 1641 nt16.92■□□□□ 0.3
LTV1P34078 Q0297Q0297 156 nt16.83■□□□□ 0.28
LTV1P34078 YBR190WYBR190W 312 nt16.8■□□□□ 0.28
LTV1P34078 RTC3YHR087W 336 nt16.39■□□□□ 0.21
LTV1P34078 YCR051WYCR051W 669 nt16.14■□□□□ 0.17
LTV1P34078 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 PUT4YOR348C 1884 nt15.93■□□□□ 0.14
LTV1P34078 CCC1YLR220W 969 nt15.78■□□□□ 0.12
LTV1P34078 RVS167YDR388W 1449 nt15.67■□□□□ 0.1
LTV1P34078 SCJ1YMR214W 1134 nt15.46■□□□□ 0.07
LTV1P34078 ARE1YCR048W 1833 nt15.38■□□□□ 0.05
LTV1P34078 POA1YBR022W 534 nt15.35■□□□□ 0.05
LTV1P34078 SCS3YGL126W 1143 nt15.29■□□□□ 0.04
LTV1P34078 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.18■□□□□ 0.02
LTV1P34078 BSC6YOL137W 1494 nt15.18■□□□□ 0.02
LTV1P34078 SPT5YML010W 3192 nt15.14■□□□□ 0.01
LTV1P34078 SAH1YER043C 1350 nt15.13■□□□□ 0.01
LTV1P34078 RPP1BYDL130W 321 nt15.11■□□□□ 0.01
LTV1P34078 URN1YPR152C 1398 nt15.05■□□□□ -0
LTV1P34078 OPI9YLR338W 858 nt14.99□□□□□ -0.01
LTV1P34078 YOL085CYOL085C 342 nt14.99□□□□□ -0.01
LTV1P34078 SSA4YER103W 1929 nt14.98□□□□□ -0.01
LTV1P34078 SHR5YOL110W 714 nt14.94□□□□□ -0.02
LTV1P34078 PKP1YIL042C 1185 nt14.88□□□□□ -0.03
LTV1P34078 DEP1YAL013W 1218 nt14.82□□□□□ -0.04
LTV1P34078 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.8□□□□□ -0.04
LTV1P34078 BUD23YCR047C 828 nt14.76□□□□□ -0.05
LTV1P34078 RPN10YHR200W 807 nt14.6□□□□□ -0.07
LTV1P34078 PET122YER153C 765 nt14.56□□□□□ -0.08
LTV1P34078 PTC2YER089C 1395 nt14.53□□□□□ -0.08
LTV1P34078 PUN1YLR414C 792 nt14.53□□□□□ -0.08
LTV1P34078 BDF1YLR399C 2061 nt14.51□□□□□ -0.09
LTV1P34078 YNL208WYNL208W 600 nt14.47□□□□□ -0.09
LTV1P34078 NAB2YGL122C 1578 nt14.44□□□□□ -0.1
LTV1P34078 MEP2YNL142W 1500 nt14.33□□□□□ -0.12
LTV1P34078 YDJ1YNL064C 1230 nt14.31□□□□□ -0.12
LTV1P34078 YJR018WYJR018W 363 nt14.3□□□□□ -0.12
LTV1P34078 TAT1YBR069C 1860 nt14.29□□□□□ -0.12
LTV1P34078 FIS1YIL065C 468 nt14.16□□□□□ -0.14
LTV1P34078 GAR1YHR089C 618 nt14.14□□□□□ -0.15
LTV1P34078 SCR1SCR1 522 nt14.13□□□□□ -0.15
LTV1P34078 DCW1YKL046C 1350 nt14.11□□□□□ -0.15
LTV1P34078 PAC11YDR488C 1602 nt14.11□□□□□ -0.15
LTV1P34078 DAL1YIR027C 1383 nt14.09□□□□□ -0.15
LTV1P34078 RRN5YLR141W 1092 nt14.04□□□□□ -0.16
LTV1P34078 FPR4YLR449W 1179 nt14.04□□□□□ -0.16
LTV1P34078 YPS1YLR120C 1710 nt14□□□□□ -0.17
LTV1P34078 PHO4YFR034C 939 nt13.97□□□□□ -0.17
LTV1P34078 NVJ2YPR091C 2313 nt13.96□□□□□ -0.18
LTV1P34078 YJR120WYJR120W 351 nt13.94□□□□□ -0.18
LTV1P34078 YBR220CYBR220C 1683 nt13.91□□□□□ -0.18
LTV1P34078 INM2YDR287W 879 nt13.88□□□□□ -0.19
LTV1P34078 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.88□□□□□ -0.19
LTV1P34078 EMI2YDR516C 1503 nt13.88□□□□□ -0.19
LTV1P34078 YMR090WYMR090W 684 nt13.82□□□□□ -0.2
LTV1P34078 YDR095CYDR095C 411 nt13.77□□□□□ -0.21
LTV1P34078 RPP2BYDR382W 333 nt13.76□□□□□ -0.21
LTV1P34078 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.76□□□□□ -0.21
LTV1P34078 SSA1YAL005C 1929 nt13.73□□□□□ -0.21
LTV1P34078 SDH1YKL148C 1923 nt13.7□□□□□ -0.22
LTV1P34078 YDL221WYDL221W 552 nt13.7□□□□□ -0.22
LTV1P34078 TIR1YER011W 765 nt13.7□□□□□ -0.22
LTV1P34078 YBL100CYBL100C 315 nt13.63□□□□□ -0.23
LTV1P34078 CAC2YML102W 1407 nt13.63□□□□□ -0.23
LTV1P34078 PCH2YBR186W 1695 nt13.59□□□□□ -0.23
LTV1P34078 FPS1YLL043W 2010 nt13.59□□□□□ -0.23
LTV1P34078 PTP1YDL230W 1008 nt13.57□□□□□ -0.24
LTV1P34078 GUT2YIL155C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
LTV1P34078 RPP2AYOL039W 321 nt13.51□□□□□ -0.25
LTV1P34078 SEC11YIR022W 504 nt13.5□□□□□ -0.25
LTV1P34078 SCC4YER147C 1875 nt13.49□□□□□ -0.25
LTV1P34078 RSB1YOR049C 1065 nt13.49□□□□□ -0.25
LTV1P34078 FUN26YAL022C 1554 nt13.45□□□□□ -0.26
LTV1P34078 ATS1YAL020C 1002 nt13.44□□□□□ -0.26
LTV1P34078 IRC15YPL017C 1500 nt13.41□□□□□ -0.26
LTV1P34078 ALF1YNL148C 765 nt13.4□□□□□ -0.26
LTV1P34078 SRB2YHR041C 633 nt13.37□□□□□ -0.27
LTV1P34078 BDH2YAL061W 1254 nt13.37□□□□□ -0.27
LTV1P34078 PIB2YGL023C 1908 nt13.35□□□□□ -0.27
LTV1P34078 GIS3YLR094C 1509 nt13.34□□□□□ -0.27
LTV1P34078 YSC84YHR016C 1407 nt13.3□□□□□ -0.28
LTV1P34078 TRM9YML014W 840 nt13.25□□□□□ -0.29
LTV1P34078 SIS1YNL007C 1059 nt13.24□□□□□ -0.29
LTV1P34078 YHL050CYHL050C 2094 nt13.2□□□□□ -0.3
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