Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.08■■□□□ 1.77
MSB4Q12317 NOP1YDL014W 984 nt25.61■■□□□ 1.69
MSB4Q12317 NSR1YGR159C 1245 nt25.35■■□□□ 1.65
MSB4Q12317 YKL036CYKL036C 393 nt24.21■■□□□ 1.47
MSB4Q12317 YJL027CYJL027C 417 nt22.74■■□□□ 1.23
MSB4Q12317 Q0297Q0297 156 nt22.59■■□□□ 1.21
MSB4Q12317 SRX1YKL086W 384 nt22.36■■□□□ 1.17
MSB4Q12317 SCS3YGL126W 1143 nt22.34■■□□□ 1.17
MSB4Q12317 MDJ1YFL016C 1536 nt21.91■■□□□ 1.1
MSB4Q12317 YCR051WYCR051W 669 nt21.3■■□□□ 1
MSB4Q12317 YOL085CYOL085C 342 nt20.95■□□□□ 0.94
MSB4Q12317 PKP1YIL042C 1185 nt20.58■□□□□ 0.89
MSB4Q12317 SCJ1YMR214W 1134 nt20.57■□□□□ 0.88
MSB4Q12317 RPP1BYDL130W 321 nt20.29■□□□□ 0.84
MSB4Q12317 ATS1YAL020C 1002 nt20.18■□□□□ 0.82
MSB4Q12317 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.82■□□□□ 0.76
MSB4Q12317 CCC1YLR220W 969 nt19.71■□□□□ 0.75
MSB4Q12317 DBP2YNL112W 1641 nt19.61■□□□□ 0.73
MSB4Q12317 SCR1SCR1 522 nt19.31■□□□□ 0.68
MSB4Q12317 PET122YER153C 765 nt19.3■□□□□ 0.68
MSB4Q12317 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.99■□□□□ 0.63
MSB4Q12317 RRN5YLR141W 1092 nt18.84■□□□□ 0.61
MSB4Q12317 RTC3YHR087W 336 nt18.75■□□□□ 0.59
MSB4Q12317 RSB1YOR049C 1065 nt18.65■□□□□ 0.58
MSB4Q12317 RVS167YDR388W 1449 nt18.65■□□□□ 0.58
MSB4Q12317 PST2YDR032C 597 nt18.56■□□□□ 0.56
MSB4Q12317 YBR190WYBR190W 312 nt18.51■□□□□ 0.55
MSB4Q12317 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.47■□□□□ 0.55
MSB4Q12317 YDJ1YNL064C 1230 nt18.34■□□□□ 0.53
MSB4Q12317 YKL097CYKL097C 411 nt18.18■□□□□ 0.5
MSB4Q12317 SHR5YOL110W 714 nt18.12■□□□□ 0.49
MSB4Q12317 GAR1YHR089C 618 nt17.89■□□□□ 0.45
MSB4Q12317 SHU1YHL006C 453 nt17.66■□□□□ 0.42
MSB4Q12317 DEP1YAL013W 1218 nt17.43■□□□□ 0.38
MSB4Q12317 YOR139CYOR139C 393 nt17.31■□□□□ 0.36
MSB4Q12317 TIR1YER011W 765 nt17.23■□□□□ 0.35
MSB4Q12317 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.23■□□□□ 0.35
MSB4Q12317 URN1YPR152C 1398 nt17.23■□□□□ 0.35
MSB4Q12317 YNL208WYNL208W 600 nt17.21■□□□□ 0.35
MSB4Q12317 RPN10YHR200W 807 nt17.13■□□□□ 0.33
MSB4Q12317 NPL3YDR432W 1245 nt17.06■□□□□ 0.32
MSB4Q12317 SSA1YAL005C 1929 nt16.88■□□□□ 0.29
MSB4Q12317 OPI9YLR338W 858 nt16.83■□□□□ 0.28
MSB4Q12317 SRB2YHR041C 633 nt16.71■□□□□ 0.27
MSB4Q12317 YGR021WYGR021W 873 nt16.68■□□□□ 0.26
MSB4Q12317 MNP1YGL068W 585 nt16.66■□□□□ 0.26
MSB4Q12317 HOM6YJR139C 1080 nt16.64■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 YGR139WYGR139W 339 nt16.63■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 YOL037CYOL037C 354 nt16.63■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 WWM1YFL010C 636 nt16.59■□□□□ 0.25
MSB4Q12317 SAH1YER043C 1350 nt16.58■□□□□ 0.24
MSB4Q12317 YJR018WYJR018W 363 nt16.47■□□□□ 0.23
MSB4Q12317 RKM5YLR137W 1104 nt16.4■□□□□ 0.22
MSB4Q12317 SSA3YBL075C 1950 nt16.37■□□□□ 0.21
MSB4Q12317 PUN1YLR414C 792 nt16.36■□□□□ 0.21
MSB4Q12317 RPP2BYDR382W 333 nt16.34■□□□□ 0.21
MSB4Q12317 YJR120WYJR120W 351 nt16.3■□□□□ 0.2
MSB4Q12317 PUT4YOR348C 1884 nt16.29■□□□□ 0.2
MSB4Q12317 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.29■□□□□ 0.2
MSB4Q12317 PUS2YGL063W 1113 nt16.28■□□□□ 0.2
MSB4Q12317 MOT3YMR070W 1473 nt16.22■□□□□ 0.19
MSB4Q12317 ARE1YCR048W 1833 nt16.21■□□□□ 0.19
MSB4Q12317 YLR281CYLR281C 468 nt16.2■□□□□ 0.18
MSB4Q12317 BSC6YOL137W 1494 nt16.1■□□□□ 0.17
MSB4Q12317 BDH2YAL061W 1254 nt16.09■□□□□ 0.17
MSB4Q12317 WHI5YOR083W 888 nt16.07■□□□□ 0.16
MSB4Q12317 PTC2YER089C 1395 nt16.07■□□□□ 0.16
MSB4Q12317 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.01■□□□□ 0.15
MSB4Q12317 LSM3YLR438C-A 270 nt16.01■□□□□ 0.15
MSB4Q12317 POA1YBR022W 534 nt15.89■□□□□ 0.13
MSB4Q12317 FMP45YDL222C 930 nt15.87■□□□□ 0.13
MSB4Q12317 INM2YDR287W 879 nt15.81■□□□□ 0.12
MSB4Q12317 YPR011CYPR011C 981 nt15.8■□□□□ 0.12
MSB4Q12317 DSK2YMR276W 1122 nt15.79■□□□□ 0.12
MSB4Q12317 MRPL8YJL063C 717 nt15.78■□□□□ 0.12
MSB4Q12317 YBL100CYBL100C 315 nt15.77■□□□□ 0.12
MSB4Q12317 NAB2YGL122C 1578 nt15.75■□□□□ 0.11
MSB4Q12317 BUD23YCR047C 828 nt15.74■□□□□ 0.11
MSB4Q12317 YCH1YGR203W 447 nt15.74■□□□□ 0.11
MSB4Q12317 YLR236CYLR236C 324 nt15.71■□□□□ 0.11
MSB4Q12317 TRM9YML014W 840 nt15.71■□□□□ 0.11
MSB4Q12317 IMP2'YIL154C 1041 nt15.7■□□□□ 0.1
MSB4Q12317 FPR4YLR449W 1179 nt15.7■□□□□ 0.1
MSB4Q12317 DAL1YIR027C 1383 nt15.67■□□□□ 0.1
MSB4Q12317 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.6■□□□□ 0.09
MSB4Q12317 FUN26YAL022C 1554 nt15.6■□□□□ 0.09
MSB4Q12317 FIS1YIL065C 468 nt15.56■□□□□ 0.08
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