Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 YML009W-BYML009W-B 477 nt34.17■■■■□ 3.06
YPK9Q12697 NOP1YDL014W 984 nt33.04■■■□□ 2.88
YPK9Q12697 NSR1YGR159C 1245 nt32.75■■■□□ 2.83
YPK9Q12697 YKL036CYKL036C 393 nt31.4■■■□□ 2.62
YPK9Q12697 YJL027CYJL027C 417 nt29.52■■■□□ 2.32
YPK9Q12697 Q0297Q0297 156 nt29.23■■■□□ 2.27
YPK9Q12697 SCS3YGL126W 1143 nt29.15■■■□□ 2.26
YPK9Q12697 SRX1YKL086W 384 nt29.02■■■□□ 2.24
YPK9Q12697 MDJ1YFL016C 1536 nt28.94■■■□□ 2.22
YPK9Q12697 YCR051WYCR051W 669 nt27.78■■■□□ 2.04
YPK9Q12697 YOL085CYOL085C 342 nt27.11■■□□□ 1.93
YPK9Q12697 PKP1YIL042C 1185 nt26.94■■□□□ 1.9
YPK9Q12697 SCJ1YMR214W 1134 nt26.3■■□□□ 1.8
YPK9Q12697 RPP1BYDL130W 321 nt26.28■■□□□ 1.8
YPK9Q12697 ATS1YAL020C 1002 nt26.05■■□□□ 1.76
YPK9Q12697 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.91■■□□□ 1.74
YPK9Q12697 CCC1YLR220W 969 nt25.76■■□□□ 1.71
YPK9Q12697 DBP2YNL112W 1641 nt25.7■■□□□ 1.7
YPK9Q12697 PET122YER153C 765 nt25.27■■□□□ 1.64
YPK9Q12697 SCR1SCR1 522 nt24.98■■□□□ 1.59
YPK9Q12697 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt24.7■■□□□ 1.55
YPK9Q12697 RRN5YLR141W 1092 nt24.43■■□□□ 1.5
YPK9Q12697 RTC3YHR087W 336 nt24.33■■□□□ 1.49
YPK9Q12697 RSB1YOR049C 1065 nt24.32■■□□□ 1.48
YPK9Q12697 RVS167YDR388W 1449 nt24.24■■□□□ 1.47
YPK9Q12697 YBR190WYBR190W 312 nt24.05■■□□□ 1.44
YPK9Q12697 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.98■■□□□ 1.43
YPK9Q12697 PST2YDR032C 597 nt23.93■■□□□ 1.42
YPK9Q12697 YDJ1YNL064C 1230 nt23.71■■□□□ 1.39
YPK9Q12697 SHR5YOL110W 714 nt23.59■■□□□ 1.37
YPK9Q12697 YKL097CYKL097C 411 nt23.58■■□□□ 1.37
YPK9Q12697 GAR1YHR089C 618 nt23.33■■□□□ 1.33
YPK9Q12697 SHU1YHL006C 453 nt23.02■■□□□ 1.28
YPK9Q12697 DEP1YAL013W 1218 nt22.97■■□□□ 1.27
YPK9Q12697 URN1YPR152C 1398 nt22.6■■□□□ 1.21
YPK9Q12697 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22.56■■□□□ 1.2
YPK9Q12697 YOR139CYOR139C 393 nt22.55■■□□□ 1.2
YPK9Q12697 TIR1YER011W 765 nt22.44■■□□□ 1.18
YPK9Q12697 YNL208WYNL208W 600 nt22.33■■□□□ 1.16
YPK9Q12697 RPN10YHR200W 807 nt22.25■■□□□ 1.15
YPK9Q12697 NPL3YDR432W 1245 nt22.17■■□□□ 1.14
YPK9Q12697 SRB2YHR041C 633 nt22.08■■□□□ 1.12
YPK9Q12697 SSA1YAL005C 1929 nt22.07■■□□□ 1.12
YPK9Q12697 MNP1YGL068W 585 nt22.03■■□□□ 1.12
YPK9Q12697 OPI9YLR338W 858 nt21.92■■□□□ 1.1
YPK9Q12697 SAH1YER043C 1350 nt21.78■■□□□ 1.08
YPK9Q12697 WWM1YFL010C 636 nt21.71■■□□□ 1.07
YPK9Q12697 HOM6YJR139C 1080 nt21.67■■□□□ 1.06
YPK9Q12697 YGR021WYGR021W 873 nt21.62■■□□□ 1.05
YPK9Q12697 YOL037CYOL037C 354 nt21.62■■□□□ 1.05
YPK9Q12697 YJR120WYJR120W 351 nt21.53■■□□□ 1.04
YPK9Q12697 YJR018WYJR018W 363 nt21.49■■□□□ 1.03
YPK9Q12697 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt21.42■■□□□ 1.02
YPK9Q12697 IMT4tM(CAU)E 72 nt21.42■■□□□ 1.02
YPK9Q12697 IMT3tM(CAU)J3 72 nt21.42■■□□□ 1.02
YPK9Q12697 IMT1tM(CAU)O1 72 nt21.42■■□□□ 1.02
YPK9Q12697 IMT2tM(CAU)P 72 nt21.42■■□□□ 1.02
YPK9Q12697 RKM5YLR137W 1104 nt21.37■■□□□ 1.01
YPK9Q12697 PUT4YOR348C 1884 nt21.35■■□□□ 1.01
YPK9Q12697 ARE1YCR048W 1833 nt21.29■■□□□ 1
YPK9Q12697 PUN1YLR414C 792 nt21.28■■□□□ 1
YPK9Q12697 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.23■□□□□ 0.99
YPK9Q12697 RPP2BYDR382W 333 nt21.21■□□□□ 0.99
YPK9Q12697 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt21.15■□□□□ 0.98
YPK9Q12697 PUS2YGL063W 1113 nt21.13■□□□□ 0.97
YPK9Q12697 MOT3YMR070W 1473 nt21.07■□□□□ 0.96
YPK9Q12697 SSA3YBL075C 1950 nt21.02■□□□□ 0.95
YPK9Q12697 PTC2YER089C 1395 nt20.98■□□□□ 0.95
YPK9Q12697 YLR281CYLR281C 468 nt20.95■□□□□ 0.94
YPK9Q12697 BDH2YAL061W 1254 nt20.94■□□□□ 0.94
YPK9Q12697 WHI5YOR083W 888 nt20.86■□□□□ 0.93
YPK9Q12697 POA1YBR022W 534 nt20.83■□□□□ 0.93
YPK9Q12697 BSC6YOL137W 1494 nt20.77■□□□□ 0.92
YPK9Q12697 BUD23YCR047C 828 nt20.77■□□□□ 0.92
YPK9Q12697 FMP45YDL222C 930 nt20.75■□□□□ 0.91
YPK9Q12697 YLR236CYLR236C 324 nt20.73■□□□□ 0.91
YPK9Q12697 YBL100CYBL100C 315 nt20.66■□□□□ 0.9
YPK9Q12697 FPR4YLR449W 1179 nt20.62■□□□□ 0.89
YPK9Q12697 FIS1YIL065C 468 nt20.61■□□□□ 0.89
YPK9Q12697 YPR011CYPR011C 981 nt20.59■□□□□ 0.89
YPK9Q12697 LSM3YLR438C-A 270 nt20.56■□□□□ 0.88
YPK9Q12697 DSK2YMR276W 1122 nt20.56■□□□□ 0.88
YPK9Q12697 NAB2YGL122C 1578 nt20.5■□□□□ 0.87
YPK9Q12697 DAL1YIR027C 1383 nt20.44■□□□□ 0.86
YPK9Q12697 PHO4YFR034C 939 nt20.43■□□□□ 0.86
YPK9Q12697 INM2YDR287W 879 nt20.37■□□□□ 0.85
YPK9Q12697 YCH1YGR203W 447 nt20.36■□□□□ 0.85
YPK9Q12697 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20.35■□□□□ 0.85
YPK9Q12697 FUN26YAL022C 1554 nt20.34■□□□□ 0.85
YPK9Q12697 TRM9YML014W 840 nt20.3■□□□□ 0.84
YPK9Q12697 LPX1YOR084W 1164 nt20.27■□□□□ 0.84
YPK9Q12697 MRPL8YJL063C 717 nt20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms