Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.4■□□□□ 0.38
WSC3Q12215 NSR1YGR159C 1245 nt17.13■□□□□ 0.33
WSC3Q12215 NOP1YDL014W 984 nt17.08■□□□□ 0.32
WSC3Q12215 YGR139WYGR139W 339 nt16.72■□□□□ 0.27
WSC3Q12215 VAR1Q0140 1197 nt16.4■□□□□ 0.22
WSC3Q12215 YKL036CYKL036C 393 nt16.01■□□□□ 0.15
WSC3Q12215 YDR509WYDR509W 348 nt15.32■□□□□ 0.04
WSC3Q12215 Q0017Q0017 162 nt15.02■□□□□ -0
WSC3Q12215 Q0297Q0297 156 nt15.01□□□□□ -0.01
WSC3Q12215 YJL027CYJL027C 417 nt15□□□□□ -0.01
WSC3Q12215 MDJ1YFL016C 1536 nt14.97□□□□□ -0.01
WSC3Q12215 SRX1YKL086W 384 nt14.89□□□□□ -0.03
WSC3Q12215 Q0142Q0142 177 nt14.88□□□□□ -0.03
WSC3Q12215 NME1NME1 340 nt14.82□□□□□ -0.04
WSC3Q12215 CSM2YIL132C 642 nt14.8□□□□□ -0.04
WSC3Q12215 PAU21YOR394W 495 nt14.75□□□□□ -0.05
WSC3Q12215 PAU22YPL282C 495 nt14.75□□□□□ -0.05
WSC3Q12215 PAM17YKR065C 594 nt14.71□□□□□ -0.05
WSC3Q12215 SCS3YGL126W 1143 nt14.69□□□□□ -0.06
WSC3Q12215 Q0144Q0144 330 nt14.65□□□□□ -0.06
WSC3Q12215 ARO7YPR060C 771 nt14.57□□□□□ -0.08
WSC3Q12215 BMT5YIL096C 1011 nt14.45□□□□□ -0.1
WSC3Q12215 MOT3YMR070W 1473 nt14.43□□□□□ -0.1
WSC3Q12215 REG2YBR050C 1017 nt14.39□□□□□ -0.11
WSC3Q12215 SEM1YDR363W-A 270 nt14.37□□□□□ -0.11
WSC3Q12215 BUR6YER159C 429 nt14.33□□□□□ -0.12
WSC3Q12215 Q0182Q0182 405 nt14.19□□□□□ -0.14
WSC3Q12215 Q0255Q0255 1419 nt14.18□□□□□ -0.14
WSC3Q12215 YOR169CYOR169C 465 nt14.17□□□□□ -0.14
WSC3Q12215 YCR051WYCR051W 669 nt14.15□□□□□ -0.14
WSC3Q12215 YGL188CYGL188C 174 nt14.07□□□□□ -0.16
WSC3Q12215 Q0010Q0010 387 nt14.02□□□□□ -0.17
WSC3Q12215 AI3Q0060 1248 nt14□□□□□ -0.17
WSC3Q12215 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.98□□□□□ -0.17
WSC3Q12215 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.98□□□□□ -0.17
WSC3Q12215 SRN2YLR119W 642 nt13.9□□□□□ -0.18
WSC3Q12215 YCR099CYCR099C 468 nt13.83□□□□□ -0.2
WSC3Q12215 YOL085CYOL085C 342 nt13.82□□□□□ -0.2
WSC3Q12215 ATP6Q0085 780 nt13.69□□□□□ -0.22
WSC3Q12215 ARP10YDR106W 855 nt13.62□□□□□ -0.23
WSC3Q12215 PKP1YIL042C 1185 nt13.56□□□□□ -0.24
WSC3Q12215 AIR1YIL079C 1083 nt13.56□□□□□ -0.24
WSC3Q12215 RPP1BYDL130W 321 nt13.47□□□□□ -0.25
WSC3Q12215 PET20YPL159C 762 nt13.47□□□□□ -0.25
WSC3Q12215 SCJ1YMR214W 1134 nt13.44□□□□□ -0.26
WSC3Q12215 ARA2YMR041C 1008 nt13.41□□□□□ -0.26
WSC3Q12215 YNR068CYNR068C 819 nt13.33□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 YPL168WYPL168W 1293 nt13.3□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 snR78snR78 87 nt13.29□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 KTR3YBR205W 1215 nt13.28□□□□□ -0.28
WSC3Q12215 DBP2YNL112W 1641 nt13.22□□□□□ -0.29
WSC3Q12215 ATS1YAL020C 1002 nt13.22□□□□□ -0.29
WSC3Q12215 YLR122CYLR122C 378 nt13.17□□□□□ -0.3
WSC3Q12215 UTP6YDR449C 1323 nt13.15□□□□□ -0.3
WSC3Q12215 CCC1YLR220W 969 nt13.15□□□□□ -0.3
WSC3Q12215 NEM1YHR004C 1341 nt13.13□□□□□ -0.31
WSC3Q12215 PHO92YDR374C 921 nt13.13□□□□□ -0.31
WSC3Q12215 SKG1YKR100C 1068 nt13.13□□□□□ -0.31
WSC3Q12215 ABZ2YMR289W 1125 nt13.1□□□□□ -0.31
WSC3Q12215 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt13.06□□□□□ -0.32
WSC3Q12215 YHL044WYHL044W 708 nt13□□□□□ -0.33
WSC3Q12215 RPM1RPM1 483 nt12.95□□□□□ -0.34
WSC3Q12215 URE2YNL229C 1065 nt12.92□□□□□ -0.34
WSC3Q12215 AST1YBL069W 1290 nt12.91□□□□□ -0.34
WSC3Q12215 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.9□□□□□ -0.34
WSC3Q12215 STD1YOR047C 1335 nt12.84□□□□□ -0.35
WSC3Q12215 SCR1SCR1 522 nt12.82□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 YDR008CYDR008C 351 nt12.81□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 PET122YER153C 765 nt12.81□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 FAR3YMR052W 615 nt12.8□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 YBR190WYBR190W 312 nt12.8□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.78□□□□□ -0.36
WSC3Q12215 PEX27YOR193W 1131 nt12.76□□□□□ -0.37
WSC3Q12215 RVS167YDR388W 1449 nt12.74□□□□□ -0.37
WSC3Q12215 YPL071CYPL071C 471 nt12.73□□□□□ -0.37
WSC3Q12215 TOM20YGR082W 552 nt12.72□□□□□ -0.37
WSC3Q12215 GTT3YEL017W 1014 nt12.67□□□□□ -0.38
WSC3Q12215 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.65□□□□□ -0.38
WSC3Q12215 HMT1YBR034C 1047 nt12.64□□□□□ -0.39
WSC3Q12215 PUS9YDL036C 1389 nt12.62□□□□□ -0.39
WSC3Q12215 FTR1YER145C 1215 nt12.61□□□□□ -0.39
WSC3Q12215 RTC3YHR087W 336 nt12.58□□□□□ -0.4
WSC3Q12215 HAS1YMR290C 1518 nt12.54□□□□□ -0.4
WSC3Q12215 LCP5YER127W 1074 nt12.52□□□□□ -0.41
WSC3Q12215 IRC14YOR135C 342 nt12.51□□□□□ -0.41
WSC3Q12215 LSM12YHR121W 564 nt12.46□□□□□ -0.41
WSC3Q12215 RRN5YLR141W 1092 nt12.46□□□□□ -0.41
WSC3Q12215 SKI6YGR195W 741 nt12.43□□□□□ -0.42
WSC3Q12215 YLR036CYLR036C 612 nt12.42□□□□□ -0.42
WSC3Q12215 MPS2YGL075C 1164 nt12.41□□□□□ -0.42
WSC3Q12215 CUS2YNL286W 858 nt12.41□□□□□ -0.42
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