RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608317.1

PAXIP1-AS1-201, Transcript of PAXIP1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene PAXIP1-AS1, Length 2,256 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.85■■■□□ 2.85
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PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.77■■■□□ 2.84
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FBLN2P98095 1184 aa32.75■■■□□ 2.83
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.72■■■□□ 2.83
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GRIN2AQ12879 1464 aa32.64■■■□□ 2.82
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PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CEP170Q5SW79 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
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PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
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PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.24■■■□□ 2.59
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PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MIA2Q96PC5 1412 aa31.24■■■□□ 2.59
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.23■■■□□ 2.59
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.2■■■□□ 2.58
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.14■■■□□ 2.58
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.13■■■□□ 2.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.12■■■□□ 2.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.1■■■□□ 2.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.576e-12■■■■■ 82.6
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.09■■■□□ 2.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.09■■■□□ 2.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
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