RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608317.1

PAXIP1-AS1-201, Transcript of PAXIP1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene PAXIP1-AS1, Length 2,256 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.42■■■■■ 5.18
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.12■■■■■ 4.17
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.62■■■■□ 3.93
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ABCC9O60706 1549 aa39.43■■■■□ 3.9
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.07■■■■□ 3.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.98■■■■□ 3.83
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.49■■■■□ 3.75
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NACADO15069 1562 aa38.4■■■■□ 3.74
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SCRIBQ14160 1630 aa38.18■■■■□ 3.7
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.12■■■■□ 3.69
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.51■■■■□ 3.59
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.57
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.16■■■■□ 3.54
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.09■■■■□ 3.53
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.78■■■■□ 3.48
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WIZO95785 1651 aa36.47■■■■□ 3.43
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SMARCA4P51532 1647 aa36.45■■■■□ 3.43
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.93■■■■□ 3.34
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.89■■■■□ 3.34
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.75■■■■□ 3.31
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SMARCA2P51531 1590 aa35.74■■■■□ 3.31
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.7■■■■□ 3.31
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NCAPD3P42695 1498 aa35.55■■■■□ 3.28
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.53■■■■□ 3.28
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 HMGXB3Q12766 1538 aa35.4■■■■□ 3.26
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.15■■■■□ 3.22
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TRIM41Q8WV44 630 aa35.11■■■■□ 3.21
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ABCC8Q09428 1581 aa35.03■■■■□ 3.2
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CFTRP13569 1480 aa34.78■■■■□ 3.16
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.71■■■■□ 3.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.65■■■■□ 3.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NESP48681 1621 aa34.64■■■■□ 3.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.6■■■■□ 3.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SYNJ1O43426 1573 aa34.57■■■■□ 3.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.42■■■■□ 3.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SOGA1O94964 1423 aa34.39■■■■□ 3.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PRDM2Q13029 1718 aa34.39■■■■□ 3.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CUX1P39880 1505 aa34.35■■■■□ 3.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.34■■■■□ 3.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.32■■■■□ 3.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TOP2BQ02880 1626 aa34.29■■■■□ 3.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.27■■■■□ 3.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.2■■■■□ 3.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.07■■■■□ 3.05
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.07■■■■□ 3.04
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.04■■■■□ 3.04
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34■■■■□ 3.03
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.97■■■■□ 3.03
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TOPBP1Q92547 1522 aa33.95■■■■□ 3.03
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.9■■■■□ 3.02
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 EEA1Q15075 1411 aa33.88■■■■□ 3.01
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.84■■■■□ 3.01
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3.01
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CUX2O14529 1486 aa33.76■■■□□ 2.99
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KIF27Q86VH2 1401 aa33.72■■■□□ 2.99
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ERCC6Q03468 1493 aa33.67■■■□□ 2.98
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.65■■■□□ 2.98
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.62■■■□□ 2.97
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GOLGA3Q08378 1498 aa33.57■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 IGF1RP08069 1367 aa33.57■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.56■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KIF21BO75037 1637 aa33.53■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PRXQ9BXM0 1461 aa33.51■■■□□ 2.96
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.48■■■□□ 2.95
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WDR62O43379 1518 aa33.46■■■□□ 2.95
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WDR97A6NE52 1622 aa33.42■■■□□ 2.94
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CEP162Q5TB80 1403 aa33.39■■■□□ 2.94
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.35■■■□□ 2.93
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.33■■■□□ 2.93
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.3■■■□□ 2.92
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.3■■■□□ 2.92
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.29■■■□□ 2.92
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 IFT140Q96RY7 1462 aa33.2■■■□□ 2.91
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CLIP1P30622 1438 aa33.13■■■□□ 2.89
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CUL7Q14999 1698 aa33.04■■■□□ 2.88
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PBRM1Q86U86 1689 aa33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GRIN2BQ13224 1484 aa32.98■■■□□ 2.87
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.88■■■□□ 2.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.87■■■□□ 2.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ADAMTS12P58397 1594 aa32.86■■■□□ 2.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ARAP1Q96P48 1450 aa32.85■■■□□ 2.85
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms