RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 ADAMTS12P58397 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
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PUF60-209ENST00000527197 CEP170Q5SW79 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 NUP160Q12769 1436 aa22.72■■□□□ 1.23
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PUF60-209ENST00000527197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.66■■□□□ 1.22
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PUF60-209ENST00000527197 SHROOM2Q13796 1616 aa22.61■■□□□ 1.21
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PUF60-209ENST00000527197 CUL7Q14999 1698 aa22.42■■□□□ 1.18
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PUF60-209ENST00000527197 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-209ENST00000527197 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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PUF60-209ENST00000527197 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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PUF60-209ENST00000527197 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
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PUF60-209ENST00000527197 DIP2BQ9P265 1576 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-209ENST00000527197 DISP1Q96F81 1524 aa22.07■■□□□ 1.12
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PUF60-209ENST00000527197 ABCC2Q92887 1545 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.02■■□□□ 1.12
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PUF60-209ENST00000527197 UACAQ9BZF9 1416 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 KIAA0556O60303 1618 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 MAP3K1Q13233 1512 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 ASXL2Q76L83 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 TIAM1Q13009 1591 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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PUF60-209ENST00000527197 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
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PUF60-209ENST00000527197 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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PUF60-209ENST00000527197 GLI2P10070 1586 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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PUF60-209ENST00000527197 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.79■■□□□ 1.08
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PUF60-209ENST00000527197 FMN1Q68DA7 1419 aa21.78■■□□□ 1.08
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PUF60-209ENST00000527197 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.76■■□□□ 1.07
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PUF60-209ENST00000527197 P3H3Q8IVL6 736 aa21.74■■□□□ 1.07
PUF60-209ENST00000527197 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.74■■□□□ 1.07
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PUF60-209ENST00000527197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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PUF60-209ENST00000527197 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.67■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 ARID3CA6NKF2 412 aa21.66■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 HECW1Q76N89 1606 aa21.61■■□□□ 1.05
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PUF60-209ENST00000527197 ATP10BO94823 1461 aa21.6■■□□□ 1.05
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PUF60-209ENST00000527197 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 ADGRL1O94910 1474 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 17.2
PUF60-209ENST00000527197 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PUF60-209ENST00000527197 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-209ENST00000527197 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.43■■□□□ 1.02
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