RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.16■■■□□ 2.74
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PUF60-209ENST00000527197 ABCC9O60706 1549 aa28.76■■■□□ 2.2
PUF60-209ENST00000527197 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.38■■□□□ 1.97
PUF60-209ENST00000527197 NACADO15069 1562 aa27.2■■□□□ 1.95
PUF60-209ENST00000527197 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.17■■□□□ 1.94
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PUF60-209ENST00000527197 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-209ENST00000527197 SCRIBQ14160 1630 aa26.3■■□□□ 1.8
PUF60-209ENST00000527197 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.18■■□□□ 1.78
PUF60-209ENST00000527197 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.97■■□□□ 1.75
PUF60-209ENST00000527197 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PUF60-209ENST00000527197 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.88■■□□□ 1.73
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PUF60-209ENST00000527197 NCAPD3P42695 1498 aa25.11■■□□□ 1.61
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PUF60-209ENST00000527197 SMARCA4P51532 1647 aa25.08■■□□□ 1.6
PUF60-209ENST00000527197 SMARCA2P51531 1590 aa24.99■■□□□ 1.59
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PUF60-209ENST00000527197 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PUF60-209ENST00000527197 ERCC6Q03468 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
PUF60-209ENST00000527197 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.81■■□□□ 1.56
PUF60-209ENST00000527197 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.8■■□□□ 1.56
PUF60-209ENST00000527197 NESP48681 1621 aa24.74■■□□□ 1.55
PUF60-209ENST00000527197 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PUF60-209ENST00000527197 CUX2O14529 1486 aa24.7■■□□□ 1.54
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PUF60-209ENST00000527197 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.46■■□□□ 1.51
PUF60-209ENST00000527197 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
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PUF60-209ENST00000527197 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.19■■□□□ 1.46
PUF60-209ENST00000527197 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PUF60-209ENST00000527197 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.12■■□□□ 1.45
PUF60-209ENST00000527197 WDR62O43379 1518 aa24.11■■□□□ 1.45
PUF60-209ENST00000527197 CFTRP13569 1480 aa24.11■■□□□ 1.45
PUF60-209ENST00000527197 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.11■■□□□ 1.45
PUF60-209ENST00000527197 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.94■■□□□ 1.42
PUF60-209ENST00000527197 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PUF60-209ENST00000527197 PRDM2Q13029 1718 aa23.87■■□□□ 1.41
PUF60-209ENST00000527197 TRIM41Q8WV44 630 aa23.75■■□□□ 1.39
PUF60-209ENST00000527197 TOPBP1Q92547 1522 aa23.67■■□□□ 1.38
PUF60-209ENST00000527197 IFT140Q96RY7 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
PUF60-209ENST00000527197 OSCARQ8IYS5 282 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-209ENST00000527197 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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PUF60-209ENST00000527197 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.5■■□□□ 1.35
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PUF60-209ENST00000527197 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PUF60-209ENST00000527197 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 58
PUF60-209ENST00000527197 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-209ENST00000527197 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PUF60-209ENST00000527197 SOGA1O94964 1423 aa23.32■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.3■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 CUX1P39880 1505 aa23.3■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 CHD1O14646 1710 aa23.29■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PUF60-209ENST00000527197 SYNJ1O43426 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-209ENST00000527197 FBLN2P98095 1184 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-209ENST00000527197 ARHGEF11O15085 1522 aa23.24■■□□□ 1.31
PUF60-209ENST00000527197 EEA1Q15075 1411 aa23.21■■□□□ 1.31
PUF60-209ENST00000527197 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.17■■□□□ 1.3
PUF60-209ENST00000527197 WDR97A6NE52 1622 aa23.16■■□□□ 1.3
PUF60-209ENST00000527197 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.15■■□□□ 1.3
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PUF60-209ENST00000527197 GRIN2BQ13224 1484 aa23.1■■□□□ 1.29
PUF60-209ENST00000527197 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.09■■□□□ 1.29
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PUF60-209ENST00000527197 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
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PUF60-209ENST00000527197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.02■■□□□ 1.28
PUF60-209ENST00000527197 SYNJ2O15056 1496 aa23.01■■□□□ 1.27
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PUF60-209ENST00000527197 CLASP1Q7Z460 1538 aa23■■□□□ 1.27
PUF60-209ENST00000527197 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.99■■□□□ 1.27
PUF60-209ENST00000527197 KIF21BO75037 1637 aa22.97■■□□□ 1.27
PUF60-209ENST00000527197 GOLGA3Q08378 1498 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-209ENST00000527197 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-209ENST00000527197 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.92■■□□□ 1.26
PUF60-209ENST00000527197 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.89■■□□□ 1.25
PUF60-209ENST00000527197 CEP162Q5TB80 1403 aa22.83■■□□□ 1.25
PUF60-209ENST00000527197 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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