RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ACTB-201ENST00000331789 GRIN2BQ13224 1484 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTB-201ENST00000331789 P3H3Q8IVL6 736 aa27.48■■□□□ 1.99
ACTB-201ENST00000331789 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS12P58397 1594 aa27.46■■□□□ 1.99
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-201ENST00000331789 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ACTB-201ENST00000331789 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ACTB-201ENST00000331789 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTB-201ENST00000331789 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.33■■□□□ 1.97
ACTB-201ENST00000331789 SAMD9Q5K651 1589 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-201ENST00000331789 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ACTB-201ENST00000331789 TIAM1Q13009 1591 aa27.28■■□□□ 1.96
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K1Q13233 1512 aa27.26■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 IQGAP2Q13576 1575 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.21■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 FMN1Q68DA7 1419 aa27.2■■□□□ 1.95
ACTB-201ENST00000331789 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 GRIN2AQ12879 1464 aa27.18■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-201ENST00000331789 SYNJ2O15056 1496 aa27.12■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ACTB-201ENST00000331789 FBLN2P98095 1184 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-201ENST00000331789 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-201ENST00000331789 CEP170Q5SW79 1584 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-201ENST00000331789 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTB-201ENST00000331789 DISP1Q96F81 1524 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-201ENST00000331789 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0556O60303 1618 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-201ENST00000331789 NUP160Q12769 1436 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-201ENST00000331789 HECW1Q76N89 1606 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTB-201ENST00000331789 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTB-201ENST00000331789 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTB-201ENST00000331789 ITGAEP38570 1179 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-201ENST00000331789 JPH4Q96JJ6 628 aa26.83■■□□□ 1.89
ACTB-201ENST00000331789 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 CHD1O14646 1710 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.8■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.79■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 ARID3CA6NKF2 412 aa26.78■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-201ENST00000331789 NCOA2Q15596 1464 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-201ENST00000331789 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-201ENST00000331789 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-201ENST00000331789 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF11O15085 1522 aa26.67■■□□□ 1.86
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ACTB-201ENST00000331789 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTB-201ENST00000331789 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTB-201ENST00000331789 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ACTB-201ENST00000331789 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ACTB-201ENST00000331789 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 ABCA8O94911 1581 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 SHROOM2Q13796 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ACTB-201ENST00000331789 PTPRKQ15262 1439 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-201ENST00000331789 PTPRGP23470 1445 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-201ENST00000331789 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTB-201ENST00000331789 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTB-201ENST00000331789 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ACTB-201ENST00000331789 MIA2Q96PC5 1412 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTB-201ENST00000331789 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-201ENST00000331789 ATP10BO94823 1461 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-201ENST00000331789 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-201ENST00000331789 KIF14Q15058 1648 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-201ENST00000331789 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-201ENST00000331789 HFM1A2PYH4 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-201ENST00000331789 UACAQ9BZF9 1416 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 MAPKBP1O60336 1514 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 NAIPQ13075 1403 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
ACTB-201ENST00000331789 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 DAPK1P53355 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 ABCC2Q92887 1545 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 ABCC5O15440 1437 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-201ENST00000331789 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.2■■□□□ 1.79
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