RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.431e-15■■■■■ 133.4
ACTB-201ENST00000331789 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 63.7
ACTB-201ENST00000331789 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 39.9
ACTB-201ENST00000331789 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.541e-36■■■■■ 39.6
ACTB-201ENST00000331789 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.76e-9■■■■■ 38.9
ACTB-201ENST00000331789 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.013e-16■■■■■ 37.4
ACTB-201ENST00000331789 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.063e-25■■■■■ 34.8
ACTB-201ENST00000331789 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.645e-27■■■■■ 34.2
ACTB-201ENST00000331789 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 33.5
ACTB-201ENST00000331789 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.269e-19■■■■■ 27
ACTB-201ENST00000331789 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.453e-11■■■■□ 24.1
ACTB-201ENST00000331789 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.052e-17■■■■□ 23
ACTB-201ENST00000331789 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 22.6
ACTB-201ENST00000331789 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.752e-34■■■■□ 20.9
ACTB-201ENST00000331789 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.323e-14■■■■□ 20.3
ACTB-201ENST00000331789 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.34■□□□□ 0.695e-9■■■■□ 20.1
ACTB-201ENST00000331789 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.623e-20■■■■□ 20.1
ACTB-201ENST00000331789 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.327e-13■■■■□ 19.9
ACTB-201ENST00000331789 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.519e-11■■■□□ 18.6
ACTB-201ENST00000331789 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.29e-7■■■□□ 18.5
ACTB-201ENST00000331789 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.285e-11■■■□□ 17.7
ACTB-201ENST00000331789 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.522e-11■■■□□ 17.4
ACTB-201ENST00000331789 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.899e-7■■■□□ 17.1
ACTB-201ENST00000331789 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.832e-12■■■□□ 16.7
ACTB-201ENST00000331789 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.432e-13■■■□□ 16.6
ACTB-201ENST00000331789 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.344e-28■■■□□ 16.6
ACTB-201ENST00000331789 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.451e-24■■■□□ 16.3
ACTB-201ENST00000331789 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.046e-17■■■□□ 16.2
ACTB-201ENST00000331789 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.661e-16■■■□□ 16.1
ACTB-201ENST00000331789 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.16e-9■■■□□ 16.1
ACTB-201ENST00000331789 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 15.9
ACTB-201ENST00000331789 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.132e-23■■■□□ 15.6
ACTB-201ENST00000331789 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.121e-10■■■□□ 15.6
ACTB-201ENST00000331789 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 15.5
ACTB-201ENST00000331789 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.583e-14■■■□□ 15
ACTB-201ENST00000331789 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.846e-21■■■□□ 14.8
ACTB-201ENST00000331789 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-30■■■□□ 14.8
ACTB-201ENST00000331789 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.432e-30■■■□□ 14.8
ACTB-201ENST00000331789 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.03□□□□□ -0.161e-13■■■□□ 14.7
ACTB-201ENST00000331789 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.382e-7■■□□□ 14.5
ACTB-201ENST00000331789 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.933e-23■■□□□ 14.2
ACTB-201ENST00000331789 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.411e-10■■□□□ 14.1
ACTB-201ENST00000331789 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 13.7
ACTB-201ENST00000331789 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-323■■□□□ 13.6
ACTB-201ENST00000331789 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 13.5
ACTB-201ENST00000331789 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.852e-7■■□□□ 13.5
ACTB-201ENST00000331789 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.581e-16■■□□□ 13.4
ACTB-201ENST00000331789 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.462e-13■■□□□ 13
ACTB-201ENST00000331789 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.652e-24■■□□□ 12.9
ACTB-201ENST00000331789 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.31□□□□□ -0.123e-16■■□□□ 12.8
ACTB-201ENST00000331789 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.726e-19■■□□□ 12.8
ACTB-201ENST00000331789 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.231e-17■■□□□ 12.5
ACTB-201ENST00000331789 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.864e-28■■□□□ 12.2
ACTB-201ENST00000331789 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.341e-323■■□□□ 12.2
ACTB-201ENST00000331789 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.822e-53■■□□□ 12.2
ACTB-201ENST00000331789 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.742e-13■■□□□ 12.1
ACTB-201ENST00000331789 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.35e-18■■□□□ 11.9
ACTB-201ENST00000331789 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.463e-35■■□□□ 11.9
ACTB-201ENST00000331789 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.263e-23■■□□□ 11.8
ACTB-201ENST00000331789 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-14■■□□□ 11.8
ACTB-201ENST00000331789 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.789e-78■■□□□ 11.7
ACTB-201ENST00000331789 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.931e-22■■□□□ 11.6
ACTB-201ENST00000331789 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.571e-12■□□□□ 11.1
ACTB-201ENST00000331789 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11e-23■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.515e-26■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-23■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.616e-51■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.953e-17■□□□□ 10.5
ACTB-201ENST00000331789 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.562e-18■□□□□ 10.5
ACTB-201ENST00000331789 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.534e-25■□□□□ 10.3
ACTB-201ENST00000331789 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.018e-19■□□□□ 10.2
ACTB-201ENST00000331789 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.366e-7■□□□□ 10
ACTB-201ENST00000331789 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.958e-18■□□□□ 9.9
ACTB-201ENST00000331789 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.744e-16■□□□□ 9.9
ACTB-201ENST00000331789 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.794e-46■□□□□ 9.9
ACTB-201ENST00000331789 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.632e-17■□□□□ 9.8
ACTB-201ENST00000331789 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.551e-10■□□□□ 9.7
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.743e-29■□□□□ 9.6
ACTB-201ENST00000331789 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.776e-13■□□□□ 9.5
ACTB-201ENST00000331789 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.913e-17■□□□□ 9.4
ACTB-201ENST00000331789 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.632e-24■□□□□ 9.3
ACTB-201ENST00000331789 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.161e-9■□□□□ 9
ACTB-201ENST00000331789 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.186e-18■□□□□ 8.9
ACTB-201ENST00000331789 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.691e-323■□□□□ 8.9
ACTB-201ENST00000331789 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.411e-78■□□□□ 8.8
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.282e-7■□□□□ 8.8
ACTB-201ENST00000331789 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.954e-22■□□□□ 8.8
ACTB-201ENST00000331789 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.232e-27■□□□□ 8.5
ACTB-201ENST00000331789 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.373e-42■□□□□ 8.5
ACTB-201ENST00000331789 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.672e-37■□□□□ 8.4
ACTB-201ENST00000331789 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.831e-47■□□□□ 8.3
ACTB-201ENST00000331789 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.123e-13■□□□□ 8.3
ACTB-201ENST00000331789 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.623e-8■□□□□ 8.2
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