RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Irx6Q9ER75 438 aa20.52■□□□□ 0.88
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Clstn2Q9ER65 966 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgap27A2AB59 869 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NacadQ5SWP3 1504 aa20.48■□□□□ 0.87
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm2aP59997 1161 aa20.43■□□□□ 0.86
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.4■□□□□ 0.86
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 IqubQ8CDK3 788 aa20.29■□□□□ 0.84
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa19.78■□□□□ 0.76
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Aebp1Q640N1 1128 aa19.72■□□□□ 0.75
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trak1Q6PD31 939 aa19.67■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Psme1P97371 249 aa19.67■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Map7O88735 730 aa19.66■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa19.66■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf316Q6PGE4 1016 aa19.65■□□□□ 0.74
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fhad1A6PWD2 1420 aa19.65■□□□□ 0.74
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cep162Q6ZQ06 1403 aa19.64■□□□□ 0.73
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