Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.08■■■■■ 6.25
NgefQ8CHT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NgefQ8CHT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
NgefQ8CHT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
NgefQ8CHT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
NgefQ8CHT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
NgefQ8CHT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NgefQ8CHT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NgefQ8CHT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NgefQ8CHT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
NgefQ8CHT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NgefQ8CHT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NgefQ8CHT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
NgefQ8CHT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
NgefQ8CHT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
NgefQ8CHT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
NgefQ8CHT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NgefQ8CHT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NgefQ8CHT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
NgefQ8CHT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NgefQ8CHT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NgefQ8CHT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
NgefQ8CHT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NgefQ8CHT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NgefQ8CHT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
NgefQ8CHT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NgefQ8CHT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NgefQ8CHT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
NgefQ8CHT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
NgefQ8CHT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NgefQ8CHT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NgefQ8CHT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NgefQ8CHT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
NgefQ8CHT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NgefQ8CHT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
NgefQ8CHT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NgefQ8CHT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NgefQ8CHT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NgefQ8CHT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NgefQ8CHT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NgefQ8CHT1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
NgefQ8CHT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NgefQ8CHT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NgefQ8CHT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NgefQ8CHT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
NgefQ8CHT1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NgefQ8CHT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NgefQ8CHT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
NgefQ8CHT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NgefQ8CHT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
NgefQ8CHT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NgefQ8CHT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
NgefQ8CHT1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
NgefQ8CHT1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NgefQ8CHT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
NgefQ8CHT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NgefQ8CHT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NgefQ8CHT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NgefQ8CHT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NgefQ8CHT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NgefQ8CHT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NgefQ8CHT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NgefQ8CHT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NgefQ8CHT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
NgefQ8CHT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NgefQ8CHT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NgefQ8CHT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NgefQ8CHT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NgefQ8CHT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NgefQ8CHT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NgefQ8CHT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NgefQ8CHT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NgefQ8CHT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NgefQ8CHT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NgefQ8CHT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NgefQ8CHT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NgefQ8CHT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NgefQ8CHT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NgefQ8CHT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NgefQ8CHT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NgefQ8CHT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NgefQ8CHT1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
NgefQ8CHT1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NgefQ8CHT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NgefQ8CHT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NgefQ8CHT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NgefQ8CHT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NgefQ8CHT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
NgefQ8CHT1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NgefQ8CHT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NgefQ8CHT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NgefQ8CHT1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NgefQ8CHT1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NgefQ8CHT1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NgefQ8CHT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NgefQ8CHT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
NgefQ8CHT1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NgefQ8CHT1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
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