Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
B4galnt3Q6L8S8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
B4galnt3Q6L8S8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
B4galnt3Q6L8S8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
B4galnt3Q6L8S8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
B4galnt3Q6L8S8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
B4galnt3Q6L8S8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
B4galnt3Q6L8S8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
B4galnt3Q6L8S8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
B4galnt3Q6L8S8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
B4galnt3Q6L8S8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
B4galnt3Q6L8S8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
B4galnt3Q6L8S8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
B4galnt3Q6L8S8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
B4galnt3Q6L8S8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
B4galnt3Q6L8S8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
B4galnt3Q6L8S8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
B4galnt3Q6L8S8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
B4galnt3Q6L8S8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
B4galnt3Q6L8S8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
B4galnt3Q6L8S8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
B4galnt3Q6L8S8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
B4galnt3Q6L8S8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
B4galnt3Q6L8S8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
B4galnt3Q6L8S8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
B4galnt3Q6L8S8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
B4galnt3Q6L8S8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
B4galnt3Q6L8S8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
B4galnt3Q6L8S8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
B4galnt3Q6L8S8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
B4galnt3Q6L8S8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
B4galnt3Q6L8S8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
B4galnt3Q6L8S8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
B4galnt3Q6L8S8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
B4galnt3Q6L8S8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
B4galnt3Q6L8S8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
B4galnt3Q6L8S8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
B4galnt3Q6L8S8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
B4galnt3Q6L8S8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
B4galnt3Q6L8S8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
B4galnt3Q6L8S8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
B4galnt3Q6L8S8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
B4galnt3Q6L8S8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
B4galnt3Q6L8S8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
B4galnt3Q6L8S8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
B4galnt3Q6L8S8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
B4galnt3Q6L8S8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
B4galnt3Q6L8S8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
B4galnt3Q6L8S8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
B4galnt3Q6L8S8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
B4galnt3Q6L8S8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
B4galnt3Q6L8S8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
B4galnt3Q6L8S8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
B4galnt3Q6L8S8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
B4galnt3Q6L8S8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
B4galnt3Q6L8S8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
B4galnt3Q6L8S8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
B4galnt3Q6L8S8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
B4galnt3Q6L8S8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
B4galnt3Q6L8S8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
B4galnt3Q6L8S8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
B4galnt3Q6L8S8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
B4galnt3Q6L8S8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
B4galnt3Q6L8S8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
B4galnt3Q6L8S8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
B4galnt3Q6L8S8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
B4galnt3Q6L8S8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
B4galnt3Q6L8S8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
B4galnt3Q6L8S8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
B4galnt3Q6L8S8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
B4galnt3Q6L8S8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
B4galnt3Q6L8S8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
B4galnt3Q6L8S8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
B4galnt3Q6L8S8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
B4galnt3Q6L8S8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
B4galnt3Q6L8S8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
B4galnt3Q6L8S8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
B4galnt3Q6L8S8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
B4galnt3Q6L8S8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
B4galnt3Q6L8S8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
B4galnt3Q6L8S8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
B4galnt3Q6L8S8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
B4galnt3Q6L8S8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
B4galnt3Q6L8S8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
B4galnt3Q6L8S8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
B4galnt3Q6L8S8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
B4galnt3Q6L8S8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
B4galnt3Q6L8S8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
B4galnt3Q6L8S8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
B4galnt3Q6L8S8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
B4galnt3Q6L8S8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
B4galnt3Q6L8S8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
B4galnt3Q6L8S8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
B4galnt3Q6L8S8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
B4galnt3Q6L8S8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
B4galnt3Q6L8S8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms