Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.53■■■■■ 6.48
Pkd2O35245 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
Pkd2O35245 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Pkd2O35245 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Pkd2O35245 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
Pkd2O35245 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
Pkd2O35245 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Pkd2O35245 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Pkd2O35245 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
Pkd2O35245 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Pkd2O35245 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
Pkd2O35245 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Pkd2O35245 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
Pkd2O35245 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Pkd2O35245 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Pkd2O35245 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
Pkd2O35245 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Pkd2O35245 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Pkd2O35245 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Pkd2O35245 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
Pkd2O35245 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Pkd2O35245 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Pkd2O35245 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Pkd2O35245 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Pkd2O35245 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Pkd2O35245 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Pkd2O35245 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Pkd2O35245 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Pkd2O35245 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
Pkd2O35245 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Pkd2O35245 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Pkd2O35245 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Pkd2O35245 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Pkd2O35245 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Pkd2O35245 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Pkd2O35245 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Pkd2O35245 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
Pkd2O35245 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
Pkd2O35245 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Pkd2O35245 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Pkd2O35245 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Pkd2O35245 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Pkd2O35245 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Pkd2O35245 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Pkd2O35245 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Pkd2O35245 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Pkd2O35245 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Pkd2O35245 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Pkd2O35245 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Pkd2O35245 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Pkd2O35245 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Pkd2O35245 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Pkd2O35245 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Pkd2O35245 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Pkd2O35245 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Pkd2O35245 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Pkd2O35245 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Pkd2O35245 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Pkd2O35245 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pkd2O35245 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pkd2O35245 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pkd2O35245 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Pkd2O35245 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Pkd2O35245 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pkd2O35245 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Pkd2O35245 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Pkd2O35245 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Pkd2O35245 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Pkd2O35245 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Pkd2O35245 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Pkd2O35245 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Pkd2O35245 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Pkd2O35245 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Pkd2O35245 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Pkd2O35245 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Pkd2O35245 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Pkd2O35245 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Pkd2O35245 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Pkd2O35245 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Pkd2O35245 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Pkd2O35245 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Pkd2O35245 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Pkd2O35245 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Pkd2O35245 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Pkd2O35245 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Pkd2O35245 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Pkd2O35245 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pkd2O35245 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pkd2O35245 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pkd2O35245 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Pkd2O35245 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Pkd2O35245 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Pkd2O35245 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pkd2O35245 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pkd2O35245 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Pkd2O35245 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Pkd2O35245 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Pkd2O35245 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Pkd2O35245 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Pkd2O35245 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms