Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.28■■■■■ 6.12
Rundc1Q0VDN7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Rundc1Q0VDN7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Rundc1Q0VDN7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Rundc1Q0VDN7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
Rundc1Q0VDN7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rundc1Q0VDN7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
Rundc1Q0VDN7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.94
Rundc1Q0VDN7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
Rundc1Q0VDN7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Rundc1Q0VDN7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Rundc1Q0VDN7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Rundc1Q0VDN7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
Rundc1Q0VDN7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Rundc1Q0VDN7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rundc1Q0VDN7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Rundc1Q0VDN7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
Rundc1Q0VDN7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rundc1Q0VDN7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Rundc1Q0VDN7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rundc1Q0VDN7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rundc1Q0VDN7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rundc1Q0VDN7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rundc1Q0VDN7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rundc1Q0VDN7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rundc1Q0VDN7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rundc1Q0VDN7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43■■■■■ 4.47
Rundc1Q0VDN7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rundc1Q0VDN7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Rundc1Q0VDN7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rundc1Q0VDN7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rundc1Q0VDN7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
Rundc1Q0VDN7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rundc1Q0VDN7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rundc1Q0VDN7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rundc1Q0VDN7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Rundc1Q0VDN7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rundc1Q0VDN7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rundc1Q0VDN7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rundc1Q0VDN7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rundc1Q0VDN7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rundc1Q0VDN7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rundc1Q0VDN7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rundc1Q0VDN7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rundc1Q0VDN7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rundc1Q0VDN7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rundc1Q0VDN7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Rundc1Q0VDN7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rundc1Q0VDN7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rundc1Q0VDN7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rundc1Q0VDN7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rundc1Q0VDN7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Rundc1Q0VDN7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Rundc1Q0VDN7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Rundc1Q0VDN7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Rundc1Q0VDN7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rundc1Q0VDN7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rundc1Q0VDN7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rundc1Q0VDN7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rundc1Q0VDN7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rundc1Q0VDN7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rundc1Q0VDN7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rundc1Q0VDN7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rundc1Q0VDN7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rundc1Q0VDN7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rundc1Q0VDN7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rundc1Q0VDN7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Rundc1Q0VDN7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Rundc1Q0VDN7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rundc1Q0VDN7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Rundc1Q0VDN7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Rundc1Q0VDN7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rundc1Q0VDN7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Rundc1Q0VDN7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rundc1Q0VDN7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Rundc1Q0VDN7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Rundc1Q0VDN7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rundc1Q0VDN7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rundc1Q0VDN7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rundc1Q0VDN7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rundc1Q0VDN7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rundc1Q0VDN7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rundc1Q0VDN7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rundc1Q0VDN7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rundc1Q0VDN7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rundc1Q0VDN7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rundc1Q0VDN7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rundc1Q0VDN7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rundc1Q0VDN7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rundc1Q0VDN7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rundc1Q0VDN7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Rundc1Q0VDN7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Rundc1Q0VDN7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms