Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.23■■■■■ 7.87
AknaQ80VW7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.92■■■■■ 7.18
AknaQ80VW7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.79■■■■■ 7
AknaQ80VW7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.22■■■■■ 6.59
AknaQ80VW7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55.21■■■■■ 6.43
AknaQ80VW7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
AknaQ80VW7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
AknaQ80VW7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.9■■■■■ 6.22
AknaQ80VW7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
AknaQ80VW7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
AknaQ80VW7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.48■■■■■ 6.15
AknaQ80VW7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
AknaQ80VW7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.26■■■■■ 5.96
AknaQ80VW7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
AknaQ80VW7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.16■■■■■ 5.94
AknaQ80VW7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
AknaQ80VW7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
AknaQ80VW7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
AknaQ80VW7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.05■■■■■ 5.76
AknaQ80VW7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
AknaQ80VW7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.01■■■■■ 5.76
AknaQ80VW7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
AknaQ80VW7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
AknaQ80VW7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
AknaQ80VW7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
AknaQ80VW7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
AknaQ80VW7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
AknaQ80VW7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
AknaQ80VW7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.27■■■■■ 5.48
AknaQ80VW7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
AknaQ80VW7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.17■■■■■ 5.46
AknaQ80VW7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
AknaQ80VW7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
AknaQ80VW7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
AknaQ80VW7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
AknaQ80VW7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
AknaQ80VW7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
AknaQ80VW7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.57■■■■■ 5.37
AknaQ80VW7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
AknaQ80VW7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
AknaQ80VW7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
AknaQ80VW7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
AknaQ80VW7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
AknaQ80VW7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
AknaQ80VW7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
AknaQ80VW7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
AknaQ80VW7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
AknaQ80VW7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
AknaQ80VW7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
AknaQ80VW7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
AknaQ80VW7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
AknaQ80VW7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
AknaQ80VW7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.9■■■■■ 5.26
AknaQ80VW7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
AknaQ80VW7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
AknaQ80VW7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
AknaQ80VW7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.42■■■■■ 5.18
AknaQ80VW7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
AknaQ80VW7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.19■■■■■ 5.14
AknaQ80VW7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
AknaQ80VW7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
AknaQ80VW7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
AknaQ80VW7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
AknaQ80VW7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
AknaQ80VW7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
AknaQ80VW7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
AknaQ80VW7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
AknaQ80VW7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
AknaQ80VW7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
AknaQ80VW7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
AknaQ80VW7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
AknaQ80VW7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
AknaQ80VW7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
AknaQ80VW7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
AknaQ80VW7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
AknaQ80VW7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
AknaQ80VW7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
AknaQ80VW7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
AknaQ80VW7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
AknaQ80VW7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
AknaQ80VW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
AknaQ80VW7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
AknaQ80VW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
AknaQ80VW7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
AknaQ80VW7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
AknaQ80VW7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
AknaQ80VW7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
AknaQ80VW7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
AknaQ80VW7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
AknaQ80VW7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
AknaQ80VW7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
AknaQ80VW7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
AknaQ80VW7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
AknaQ80VW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms