Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Lmod3E9QA62 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lmod3E9QA62 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lmod3E9QA62 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lmod3E9QA62 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmod3E9QA62 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Lmod3E9QA62 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Lmod3E9QA62 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lmod3E9QA62 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Lmod3E9QA62 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lmod3E9QA62 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lmod3E9QA62 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lmod3E9QA62 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lmod3E9QA62 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod3E9QA62 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmod3E9QA62 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod3E9QA62 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmod3E9QA62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmod3E9QA62 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lmod3E9QA62 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmod3E9QA62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lmod3E9QA62 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lmod3E9QA62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmod3E9QA62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmod3E9QA62 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod3E9QA62 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmod3E9QA62 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmod3E9QA62 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod3E9QA62 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmod3E9QA62 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod3E9QA62 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lmod3E9QA62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmod3E9QA62 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod3E9QA62 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmod3E9QA62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmod3E9QA62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmod3E9QA62 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod3E9QA62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod3E9QA62 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod3E9QA62 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod3E9QA62 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmod3E9QA62 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lmod3E9QA62 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod3E9QA62 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lmod3E9QA62 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod3E9QA62 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod3E9QA62 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lmod3E9QA62 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmod3E9QA62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod3E9QA62 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmod3E9QA62 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod3E9QA62 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod3E9QA62 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmod3E9QA62 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmod3E9QA62 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lmod3E9QA62 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lmod3E9QA62 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lmod3E9QA62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lmod3E9QA62 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lmod3E9QA62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmod3E9QA62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod3E9QA62 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lmod3E9QA62 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod3E9QA62 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod3E9QA62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod3E9QA62 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lmod3E9QA62 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lmod3E9QA62 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lmod3E9QA62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lmod3E9QA62 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Lmod3E9QA62 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod3E9QA62 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod3E9QA62 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod3E9QA62 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod3E9QA62 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lmod3E9QA62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmod3E9QA62 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod3E9QA62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmod3E9QA62 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod3E9QA62 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmod3E9QA62 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod3E9QA62 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lmod3E9QA62 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lmod3E9QA62 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lmod3E9QA62 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmod3E9QA62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod3E9QA62 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Lmod3E9QA62 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lmod3E9QA62 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmod3E9QA62 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmod3E9QA62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod3E9QA62 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod3E9QA62 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod3E9QA62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod3E9QA62 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod3E9QA62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod3E9QA62 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod3E9QA62 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lmod3E9QA62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Lmod3E9QA62 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms