Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Trim30dE9PWL0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Trim30dE9PWL0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Trim30dE9PWL0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Trim30dE9PWL0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Trim30dE9PWL0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Trim30dE9PWL0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Trim30dE9PWL0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim30dE9PWL0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Trim30dE9PWL0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Trim30dE9PWL0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Trim30dE9PWL0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trim30dE9PWL0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Trim30dE9PWL0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim30dE9PWL0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Trim30dE9PWL0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Trim30dE9PWL0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim30dE9PWL0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Trim30dE9PWL0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Trim30dE9PWL0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim30dE9PWL0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim30dE9PWL0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Trim30dE9PWL0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim30dE9PWL0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim30dE9PWL0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Trim30dE9PWL0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trim30dE9PWL0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim30dE9PWL0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Trim30dE9PWL0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Trim30dE9PWL0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim30dE9PWL0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim30dE9PWL0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim30dE9PWL0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim30dE9PWL0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim30dE9PWL0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim30dE9PWL0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim30dE9PWL0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Trim30dE9PWL0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Trim30dE9PWL0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim30dE9PWL0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Trim30dE9PWL0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim30dE9PWL0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim30dE9PWL0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Trim30dE9PWL0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim30dE9PWL0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Trim30dE9PWL0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim30dE9PWL0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Trim30dE9PWL0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Trim30dE9PWL0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim30dE9PWL0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trim30dE9PWL0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trim30dE9PWL0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim30dE9PWL0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim30dE9PWL0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim30dE9PWL0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim30dE9PWL0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim30dE9PWL0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim30dE9PWL0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim30dE9PWL0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim30dE9PWL0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim30dE9PWL0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trim30dE9PWL0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Trim30dE9PWL0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Trim30dE9PWL0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim30dE9PWL0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trim30dE9PWL0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trim30dE9PWL0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim30dE9PWL0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Trim30dE9PWL0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trim30dE9PWL0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Trim30dE9PWL0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trim30dE9PWL0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trim30dE9PWL0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trim30dE9PWL0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim30dE9PWL0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim30dE9PWL0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim30dE9PWL0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Trim30dE9PWL0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Trim30dE9PWL0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trim30dE9PWL0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trim30dE9PWL0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trim30dE9PWL0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim30dE9PWL0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim30dE9PWL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Trim30dE9PWL0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trim30dE9PWL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trim30dE9PWL0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trim30dE9PWL0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trim30dE9PWL0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trim30dE9PWL0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim30dE9PWL0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim30dE9PWL0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim30dE9PWL0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim30dE9PWL0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim30dE9PWL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trim30dE9PWL0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim30dE9PWL0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim30dE9PWL0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim30dE9PWL0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim30dE9PWL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms