Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
Fgd1P52734 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Fgd1P52734 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Fgd1P52734 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Fgd1P52734 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Fgd1P52734 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Fgd1P52734 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Fgd1P52734 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Fgd1P52734 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Fgd1P52734 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Fgd1P52734 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Fgd1P52734 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Fgd1P52734 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Fgd1P52734 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Fgd1P52734 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.26■■■■□ 3.87
Fgd1P52734 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Fgd1P52734 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Fgd1P52734 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Fgd1P52734 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Fgd1P52734 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Fgd1P52734 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fgd1P52734 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Fgd1P52734 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Fgd1P52734 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Fgd1P52734 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fgd1P52734 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Fgd1P52734 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Fgd1P52734 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Fgd1P52734 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Fgd1P52734 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Fgd1P52734 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Fgd1P52734 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fgd1P52734 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Fgd1P52734 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fgd1P52734 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fgd1P52734 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Fgd1P52734 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Fgd1P52734 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Fgd1P52734 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fgd1P52734 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fgd1P52734 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Fgd1P52734 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fgd1P52734 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fgd1P52734 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fgd1P52734 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Fgd1P52734 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Fgd1P52734 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Fgd1P52734 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Fgd1P52734 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fgd1P52734 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fgd1P52734 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Fgd1P52734 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fgd1P52734 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fgd1P52734 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fgd1P52734 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fgd1P52734 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fgd1P52734 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fgd1P52734 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fgd1P52734 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Fgd1P52734 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fgd1P52734 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fgd1P52734 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fgd1P52734 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fgd1P52734 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fgd1P52734 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fgd1P52734 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fgd1P52734 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fgd1P52734 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fgd1P52734 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fgd1P52734 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Fgd1P52734 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fgd1P52734 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd1P52734 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fgd1P52734 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fgd1P52734 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fgd1P52734 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Fgd1P52734 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fgd1P52734 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fgd1P52734 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fgd1P52734 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fgd1P52734 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fgd1P52734 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fgd1P52734 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fgd1P52734 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fgd1P52734 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Fgd1P52734 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Fgd1P52734 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fgd1P52734 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fgd1P52734 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Fgd1P52734 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fgd1P52734 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd1P52734 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fgd1P52734 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fgd1P52734 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fgd1P52734 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fgd1P52734 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fgd1P52734 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd1P52734 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd1P52734 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fgd1P52734 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.1 ms