Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.98■■■■■ 6.07
Cnga1P29974 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
Cnga1P29974 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Cnga1P29974 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
Cnga1P29974 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
Cnga1P29974 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
Cnga1P29974 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
Cnga1P29974 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cnga1P29974 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Cnga1P29974 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Cnga1P29974 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Cnga1P29974 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Cnga1P29974 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Cnga1P29974 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Cnga1P29974 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Cnga1P29974 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Cnga1P29974 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Cnga1P29974 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
Cnga1P29974 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Cnga1P29974 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Cnga1P29974 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Cnga1P29974 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cnga1P29974 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Cnga1P29974 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Cnga1P29974 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Cnga1P29974 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Cnga1P29974 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cnga1P29974 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Cnga1P29974 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cnga1P29974 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Cnga1P29974 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Cnga1P29974 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Cnga1P29974 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Cnga1P29974 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Cnga1P29974 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Cnga1P29974 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Cnga1P29974 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cnga1P29974 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cnga1P29974 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cnga1P29974 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cnga1P29974 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Cnga1P29974 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cnga1P29974 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cnga1P29974 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cnga1P29974 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cnga1P29974 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Cnga1P29974 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Cnga1P29974 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cnga1P29974 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cnga1P29974 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cnga1P29974 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cnga1P29974 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cnga1P29974 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Cnga1P29974 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cnga1P29974 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cnga1P29974 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Cnga1P29974 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cnga1P29974 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Cnga1P29974 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cnga1P29974 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Cnga1P29974 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cnga1P29974 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cnga1P29974 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Cnga1P29974 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Cnga1P29974 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cnga1P29974 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Cnga1P29974 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cnga1P29974 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Cnga1P29974 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Cnga1P29974 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Cnga1P29974 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cnga1P29974 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Cnga1P29974 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cnga1P29974 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cnga1P29974 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Cnga1P29974 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Cnga1P29974 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Cnga1P29974 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Cnga1P29974 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Cnga1P29974 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cnga1P29974 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Cnga1P29974 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cnga1P29974 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cnga1P29974 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cnga1P29974 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Cnga1P29974 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Cnga1P29974 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Cnga1P29974 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Cnga1P29974 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Cnga1P29974 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cnga1P29974 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Cnga1P29974 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Cnga1P29974 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cnga1P29974 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Cnga1P29974 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cnga1P29974 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cnga1P29974 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cnga1P29974 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cnga1P29974 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Cnga1P29974 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms