Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.98■■■■■ 5.59
Iqcf3Q9D498 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Iqcf3Q9D498 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Iqcf3Q9D498 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Iqcf3Q9D498 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Iqcf3Q9D498 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Iqcf3Q9D498 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Iqcf3Q9D498 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Iqcf3Q9D498 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Iqcf3Q9D498 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Iqcf3Q9D498 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Iqcf3Q9D498 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Iqcf3Q9D498 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Iqcf3Q9D498 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Iqcf3Q9D498 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Iqcf3Q9D498 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Iqcf3Q9D498 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Iqcf3Q9D498 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Iqcf3Q9D498 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Iqcf3Q9D498 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Iqcf3Q9D498 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Iqcf3Q9D498 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Iqcf3Q9D498 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Iqcf3Q9D498 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Iqcf3Q9D498 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Iqcf3Q9D498 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Iqcf3Q9D498 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Iqcf3Q9D498 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Iqcf3Q9D498 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Iqcf3Q9D498 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Iqcf3Q9D498 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Iqcf3Q9D498 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Iqcf3Q9D498 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Iqcf3Q9D498 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Iqcf3Q9D498 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Iqcf3Q9D498 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Iqcf3Q9D498 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Iqcf3Q9D498 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Iqcf3Q9D498 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Iqcf3Q9D498 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Iqcf3Q9D498 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Iqcf3Q9D498 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Iqcf3Q9D498 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Iqcf3Q9D498 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Iqcf3Q9D498 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Iqcf3Q9D498 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Iqcf3Q9D498 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Iqcf3Q9D498 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Iqcf3Q9D498 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Iqcf3Q9D498 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Iqcf3Q9D498 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Iqcf3Q9D498 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Iqcf3Q9D498 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Iqcf3Q9D498 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Iqcf3Q9D498 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Iqcf3Q9D498 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Iqcf3Q9D498 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Iqcf3Q9D498 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Iqcf3Q9D498 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Iqcf3Q9D498 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Iqcf3Q9D498 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Iqcf3Q9D498 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Iqcf3Q9D498 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Iqcf3Q9D498 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Iqcf3Q9D498 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Iqcf3Q9D498 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Iqcf3Q9D498 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Iqcf3Q9D498 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Iqcf3Q9D498 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Iqcf3Q9D498 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Iqcf3Q9D498 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Iqcf3Q9D498 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Iqcf3Q9D498 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Iqcf3Q9D498 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Iqcf3Q9D498 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Iqcf3Q9D498 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Iqcf3Q9D498 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Iqcf3Q9D498 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Iqcf3Q9D498 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Iqcf3Q9D498 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Iqcf3Q9D498 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Iqcf3Q9D498 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Iqcf3Q9D498 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Iqcf3Q9D498 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Iqcf3Q9D498 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Iqcf3Q9D498 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Iqcf3Q9D498 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Iqcf3Q9D498 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Iqcf3Q9D498 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Iqcf3Q9D498 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Iqcf3Q9D498 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Iqcf3Q9D498 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Iqcf3Q9D498 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Iqcf3Q9D498 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Iqcf3Q9D498 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms